你知道关于如何在python,R(Bioconductor)中实现HMM的任何好的文献和/或教程吗? (尤其是序列分析)隐藏的马尔可夫模型在R或python中的实现
3
A
回答
5
CRAN上有HMM包,它可能是一个很好的开始。
http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/index.html
这是很容易与R本身发现:
RSiteSearch("HMM")
5
GHMM对Python有一个tutorial,但它的短,他们承认 “Currently, the GHMM is utterly lacking in documentation.”
我对the use of HMM for genetic mapping有技术报告。
我推荐阅读一下Rabiner,然后实现一些东西。前进/后退方程只是几行。
相关问题
- 1. 在.net中隐藏马尔可夫模型实现?
- 2. 隐马尔可夫模型
- 3. 隐马尔可夫模型工具:Jahmm
- 4. 用C++隐马尔可夫模型
- 5. R中训练隐马尔可夫模型
- 6. 为什么在鲍姆韦尔奇算法中使用隐马尔可夫模型与马尔可夫模型
- 7. 隐马尔可夫模型中的计算分布
- 8. 时间序列的隐马尔可夫模型
- 9. 使用隐马尔可夫模型的手形分析
- 10. 隐马尔可夫模型的并行前后向算法
- 11. 马尔可夫链测试和实现
- 12. 流利NHibernate:模型马尔可夫链
- 13. Python:保持转换概率的数据结构隐马尔可夫模型
- 14. 隐马尔可夫模型预测下一个观察
- 15. 隐马尔可夫模型贝叶斯关系
- 16. 基本隐马尔可夫模型,维特比算法
- 17. 如何适应数据到隐马尔可夫模型sklearn/hmmlearn
- 18. 使用隐马尔可夫模型设计AI mp3播放器
- 19. 马尔可夫模型和句子生成器项目(Python)!
- 20. 马尔可夫交换 - 自回归R
- 21. 在OpenCV中实现马尔可夫随机场吗?
- 22. 如何更新c#中隐马尔可夫模型的概率值?
- 23. 用于离散马尔可夫链模拟的R库
- 24. 在马尔可夫模型中计算n先行状态
- 25. R中的简单马尔可夫链(可视化)
- 26. 转换和发射矩阵隐马尔可夫模型MATLAB的初始猜测?
- 27. 什么样的HMM(隐马尔科夫模型)压缩库可用于.NET?
- 28. 如何找到隐马尔可夫模型求解问题的例子?
- 29. 具有多个时间独立流的隐马尔可夫模型
- 30. 使用haar训练和隐马尔可夫模型的手势识别
尝试在stats.stackexchange.com上询问 - 或者mod可以将此q移动到那里。 – Spacedman