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    集群计算作业是立即提交还是持续访问？

    我通常在集群计算机上工作。我有一些非常大的Rscript用于运行数据。完整的Rscript需要大约5个小时才能运行。为此，我通过使用qsub提交作业来使用群集。这使我可以离开我的电脑并等待集群运行。但是，我想运行这个特殊的Rscript 20个不同的次数进行微小的更改。 我一直在做的是等待集群作业完成。然后进入Rscript并修改文件名，然后将另一个作业发送到群集。 我的问题是这样的：在我将作业提
    r cluster-computing qsub rscript 2016-06-07

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    命令专门对单个实例中cfncluster-SGE调度

    运行工作，我想用SGE调度的qsub选项专门作业提交到一个单一节点cfncluster。 有谁知道在cfncluster中保留或使用完整实例作业的正确方法。 qsub -l [email protected] script.sh 的作品，但我不想指定主机名，因为我们不知道 主机节点，因为它没有被纺起来。有没有任何选项来指定节点或核心的数量。谢谢。
    cluster-computing pbs qsub sungridengine 2016-07-27

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    等待已完成的作业

    一旦其他人完成，我将启动一个pbs脚本。对于我使用这个命令： $ job1=$(qsub job1.pbs) $ jobN=$(qsub jobN.pbs) $ qsub -W depend=afterok:$job1:$jobN join.pbs 这工作，在大多数情况下。但是，如果我在job1和jobN已完成时运行加入脚本，它将无限期地空闲，因为它正在等待已完成的作业完成。这听起来很疯狂
    cluster-computing hpc pbs qsub torque 2016-07-28

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    QSUB：指定在工作阵列中的每个任务输出和错误文件

    但愿这不是一个dublicate，也不仅仅是我们的群集配置的问题... 我使用qsub提交作业阵列集群用下面的命令： qsub -q QUEUE -N JOBNAME -t 1:10 -e ${ERRFILE}_$SGE_TASK_ID /path/to/script.sh 其中 ERRFILE=/home/USER/somedir/errors. 的想法是指定错误文件（类似地也输出文件）
    bash cluster-computing qsub sungridengine 2016-06-09

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    如何使用Torque在多个队列中提交作业？

    使用qsub我可以在同一个队列作业提交到多个节点： qsub -I -q normal -l nodes=2:ppn=16 不过，我有一个名为超级另一个队列，是否有可能在两个不同的队列提交作业？ 概念上的东西是这样的： qsub -I -l queue=normal:nodes=2:ppn=16,queue=hyper:nodes=2:ppn=16
    qsub torque 2016-06-11

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    了解-t选项的qsub

    该文档是有点不清楚的正是-t选项使用qsub http://docs.adaptivecomputing.com/torque/4-0-2/Content/topics/commands/qsub.htm 从文档的作业提交做： - t指定作业数组的任务ID。单任务数组是允许的。 array_request参数是一个整数id或一个整数范围。 可以在逗号分隔列表中组合多个ID或ID范围。 例子：-t
    pbs qsub torque 2016-06-12

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    在队列中编辑模拟文件

    假设我向PBS提交了一个文件（file1.pbs），并且它已经排队。在这个文件中，我指的是计算机将运行的第二个文件（file2.namd）。然后，当file1.pbs排队时，我在file2.namd中做了一个重要的更改。一旦保存了file2.namd，我就检查这个作业，并且它仍然排队（尚未运行）。 我的问题是：即使作业已经排队，该更改是否会被执行，或者计算机是否已经读取了file2.namd？ 谢
    pbs qsub 2016-06-13

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    PBS：如何打印作业运行的历史记录以及如何使用脚本名称作为PBS_JOBNAME？

    qsub和HPC的新成员。我有三个小问题： 我想知道哪个作业脚本对应哪个stderr和stdout。我知道我可以手动输入工作名称和他们的stderr和stdout像这样（现在我使用$ PBS_JOBNAME。$ PBS_JOBID作为stderr和stdout），但是从现在起6个月，我很难知道从中生成作业脚本stderr和stdout $ PBS_JOBNAME。$ PBS_JOBID。我正在考虑
    pbs qsub torque 2016-08-03

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    SGE faild提交作业，属性不是内存值

    我未能提交具有mem属性的作业。由于我是新手，谷歌两天后，我在这里寻求帮助。任何建议将不胜感激！ 以下是我所做的： \ 1。提交我的稿子： qsub -S /bin/bash -A assembly -pe threads 16 -l mem=2GB -cwd -N "pBcR_correct_asm" -j y -o /dev/null runCorrection.sh Unable to
    qsub sungridengine 2016-08-05

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    SGE提交的作业不运行

    我在我的ubuntu 14.04上使用Sun Grid Engine将我的作业排队等待在多核CPU上运行。 我已经在我的系统上安装并设置了SGE，但在测试时出现问题。我创建了一个“hello_world”目录，它包含两个名为“hello_world.sh”的shell脚本，第一个包括一个简单的命令，第二个包括qsub命令，将第一个脚本文件作为要运行的作业提交。 下面是 “hello_world.s
    job-scheduling qsub sungridengine 2016-05-16
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