错误数据的读取和文件夹合并成一个数据帧

如果有帮助，我在MacBook Pro上的操作系统船长巨岩运行v 3.3.1 ...错误数据的读取和文件夹合并成一个数据帧

我想类似的文件夹中阅读数据文件。我检查目录和文件，他们应该是：

list.files('../data/') 
[1] "B101.txt" "B101p2.txt" "B116.txt" "B6.txt"  "B65.txt" "B67.txt" "B67p2.txt" 
[8] "B70.txt" "B71.txt" "B71p2.txt" "B95.txt" "B95p2.txt" "B96.txt" "B96p2.txt" 
[15] "B98.txt" "B98p2.txt" "B99.txt" "B99p2.txt"

以下是我的代码和错误：

a = ldply(
    .data = list.files(
     path = '../data/' 
      ) 
    , .fun = function(x){ 
     to_return = read.table(
      file = x 
      , skip = 20 
      , sep = '\t' 
      , fill = TRUE 
       ) 
     return(to_return) 
      } 
    , .progress = 'text' 
) 

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection 
In addition: Warning message: 
In file(file, "rt") : 
    cannot open file 'B101.txt': No such file or directory

我不知道是什么问题，为那些所有搜索错误提示修复目录。我还检查数据文件，并可以读取使用一个单独的文件：

read.table('../data/B101.txt', skip = 20, sep = '\t', fill=TRUE)

可能有人请帮我解决的整个文件夹读取问题。我试图用少量的文件来理清脚本，但是需要它来运行一个更大的数字，所以逐个阅读它们是不现实的。谢谢。

来源

2016-08-17 Oriane Landry

默认情况下，list.files返回只有文件名本身，不包括领先的（相对或绝对）路径（如果有的话）。当处理可能位于另一个目录中的文件时，需要包含full.names = TRUE：

a = ldply(
    .data = list.files(
     path = '../data/', 
     full.names = TRUE 
      ) 
    , .fun = function(x){ 
     to_return = read.table(
      file = x 
      , skip = 20 
      , sep = '\t' 
      , fill = TRUE 
       ) 
     return(to_return) 
      } 
    , .progress = 'text' 
)

来源

2016-08-17 05:21:06 r2evans

错误数据的读取和文件夹合并成一个数据帧

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