NumPy recfunctions join_by TypeError

当我尝试在NumPy 1.11或1.12（Python 3.5）中将“uint16”字段连接到结构化数组时，会遇到TypeError。NumPy recfunctions join_by TypeError

import numpy as np 
from numpy.lib import recfunctions as rfn 
foo = np.array([(1,)], 
       dtype=[('key', int)]) 
bar = np.array([(1,np.array([1,2,3]))], 
       dtype=[('key', int), ('value', 'uint16', 3)]) 
rfn.join_by('key', foo, bar)

这是错误：

Traceback (most recent call last): 
    File "<stdin>", line 1, in <module> 
    File "/home/user/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/lib/recfunctions.py", line 986, in join_by 
    output.sort(order=key) 
    File "/home/user/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/ma/core.py", line 5420, in sort 
    sidx = self.filled(filler).argsort(axis=axis, kind=kind, 
    File "/home/user/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/ma/core.py", line 3668, in filled 
    fill_value = _check_fill_value(fill_value, self.dtype) 
    File "/home/user/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/ma/core.py", line 470, in _check_fill_value 
    fill_value = np.array(_recursive_set_fill_value(fill_value, ndtype), 
    File "/home/user/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/numpy/ma/core.py", line 436, in _recursive_set_fill_value 
    output_value.append(np.array(fval, dtype=cdtype).item()) 
TypeError: int() argument must be a string, a bytes-like object or a number, not 'NoneType'

如果我使用 'float16' 不会出现同样的问题。

import numpy as np 
from numpy.lib import recfunctions as rfn 
foo = np.array([(1,)], 
       dtype=[('key', int)]) 
bar = np.array([(1,np.array([1,2,3]))], 
       dtype=[('key', int), ('value', 'float16', 3)]) 
rfn.join_by('key', foo, bar)

这只是一个错误？或者有什么办法可以防止这个问题？

来源

2017-06-26 eatcrayons

看起来像我的错误 - 你应该在bug跟踪 – Eric

报告它的缺陷是明显的更简单地称为'bar.view（ np.ma.MaskedArray）.sort（）' – Eric

@Eric - 啊......所以它可能与[这个bug]密切相关（https://github.com/numpy/numpy/issues/8069）。 – eatcrayons

这是一个错误。 This PR部分修复了它，但似乎你偶然发现了一堆与np.ma和子类型有关的蠕虫。

至于为什么它的工作float16 - None被强制为nan（一个可疑的功能），而不是错误。

编辑： PR合并，这将是固定在numpy的1.14

来源

2017-06-27 00:15:05 Eric

感谢您的关注！我会看看现在是否可以找到解决方法。 – eatcrayons

虽然不是这个问题的具体答案，[本文]（https://stackoverflow.com/questions/13795390/numpy-append-field-gives-shape-error-for-new-field-with-2d-shape ）为我提供了足够的信息来开发使用merge_arrays的解决方法。 – eatcrayons

NumPy recfunctions join_by TypeError

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