将基于指针的结构传递给cuda

我有C代码，它使用指向struct的指针。我试图找出如何将它传递给cuda而没有太多的运气。将基于指针的结构传递给cuda

我

typedef struct node {  /* describes a tip species or an ancestor */ 
    struct node *next, *back; /* pointers to nodes      */ 
etc... 
} node;

然后

typedef node **pointptr; 
static pointptr treenode;

在我的代码我经历了所有这些迭代，而我试图找出如何将它们传递给内核，所以我可以执行以下操作：

for (i = 1; i <= nonodes; i++) { 
    treenode[i - 1]->back = NULL; 
    etc.... 
}

但我想不出如何通过它。任何想法？

来源

2011-11-06 Izri

问题是，为了在内核中使用您的树，您的next和back应该可能指向设备内存中的某处。假设你构建主机上的树，然后通过它，你可以这样做：

node* traverse(node*n){ 
    if (n==NULL) 
     return NULL; 

    node x, *d; 
    x.back = traverse(n->back); 
    x.next = traverse(n->next); 
    cudaMalloc(&d, sizeof(node)); 
    cudaMemcpy(d, &x, sizeof(node), cudaMemcpyHostToDevice); 
    return d; 
}

，并通过调用它的根你会最终有一个指针树的根在设备内存，你可以直接传递给你的内核。我没有测试过这个代码，你必须写一些类似的东西来删除树。

或者，您可以将您的树节点连续存储在数组内，索引号为back和next，而不是指针（如有必要，可能会将其更改回设备代码中的指针）。

来源

2011-11-06 17:16:09 Vlad