igraph

0热度

1回答

一个简单的网络图我有一个数据帧作为 mydf <- data.frame(ID = c(1,2,3,4,5), MatchedID = c(3,4,2,5,1), Weight = c(12,45,5,19,9)) 我要绘制显示ID和matchedID和权重之间的关系为关系的强度的网络图。什么是最好的方式来表示这与标签？我喜欢那些在https://briatte.github.io/ggne

0热度

1回答

如何通过边列表迭代的igraph R接入顶点

我试图用一个for循环像这样来访问每个顶点对的顶点的边缘： for (e in E(G)) { do stuff } 不过，我不知道该怎么得到每个顶点e。我试图返回顶点列表中每个顶点的类型。我可以得到顶点属性像我下面做，虽然我不知道这是否是通过边缘列表进行迭代，并让所有的边缘的确定方式： i = 1 for (e in get.edgelist(G)) { if(V(G)[get

1热度

1回答

igraph即使存在几条边也会显示所有顶点

我有一个稀疏的200x200矩阵，并且只有8条边（非零权重）。图表“rng”具有以下信息： > rng IGRAPH UNW- 200 8 -- + attr: name (v/c), weight (e/n) + edges (vertex names): [1] CDH1 --DLC1 CDH1 --KRTAP2.3 DLC1 --KRTAP2.3 DLC1 --NRG1 [5]

0热度

1回答

使用igraph查找连接到顶点的所有顶点？

是否有一个函数可以使用R的igraph库查找连接到图中顶点的顶点数量？顶点不需要通过直接边连接，它们之间可以有更长的路径长度 - 它们只需要“连接”即可。

2热度

1回答

用于拟合网络度数分布的幂律的输入

我想用R来测试网络的度数分布是否像无幂性的幂律一样。尽管如此，我读过不同的人以许多不同的方式来做这件事，一个令人困惑的地方是模型中应该使用的输入。例如，我读过Barabasi，建议将幂律适合度为(see Advanced Topic 3.B of chapter 4, figure 4.22的'补充累积分布'。但是，我见过的人适合幂律的度（随igraph::degree(g)获得），而我也看到其

2热度

1回答

R igraph曲线的边缘

我想在R中绘制一些星形图。但是，如果绘制（大）完整图形（例如K_5），则会出现从一个节点到另一个节点通过中心节点的边缘。你可以看到在这example（我是新来的，因此我认为我不能直接上传图片）。现在，如果我曲线的所有边缘，我得到this。但是这看起来也有点难看。我只想曲线边缘{2,4}和{3,5}。这可能吗？在此先感谢编辑： Sry基因，“全图”只是一个例子来获得一类问题的图形。您可以绘制此

0热度

1回答

使用igraph绘制网络时的巨大箭头

编辑我试图弄清楚我的代码出了什么问题，我开始绘制简单的图形以查看箭头在较小图形上的显示方式。我累了下面的命令： g2 <- graph(edges=c(1,2, 2,3, 3, 1), n=10) plot(g2) 这是我的图：。因此，我认为问题不在于我的代码，而在于使用igraph或R。我重新安装了两者，igraph和R，但它没有解决问题。是否有导致这种情况的软件包冲突？下面是一个点

0热度

1回答

如何在python-igraph中为模块设置分辨率？

我有一个pajek .net格式的图G，我使用igraph读取并使用Louvain方法使用社区检测。但我希望能够手动更改分辨率，以查看模块性如何变化，以及随后如何更改群集。我可以在计算模块性之前更改gephi中的分辨率。如果是这样，这可能吗？如何？如果在networkx中有这种可能，我也愿意使用networkx。

0热度

1回答

Python的Networkx到R igraph转换有错误

我试图将下面的Python代码（Networkx）转换为R（对于igraph）。 # Python code import csv import networkx as nx import urllib DG=nx.DiGraph() dogcsv=csv.DictReader(open("dogs.csv","rU")) dogid=0 nodeStr=['id', 's

0热度

1回答

从igraph检索路径名列表all_simple_paths

我有一个有向循环矩阵，需要提取任何i和j之间的所有简单路径。以下是我的前任。矩阵： >M2<-matrix(c(1,1,0,0,0,1,1,1,1,0,0,1,1,1,0,0,1,0,1,1,0,0,0,1,1), 5, byrow=T) >colnames(M2)<-c("A", "B", "C", "D", "E") >row.names(M2)=colnames(M2) >M2