通过XGrid运行BLAST

Question

有没有人有使用XGrid运行BLAST的经验？

谷歌搜索显示一个名为'Xgrid BLAST'的工具存在，但没有获得。

Answer 1

BLAST包含在Xgrid中。从“Utilization of a Local Grid of Mac OS X-Based Computers using Xgrid”引用：

的Xgrid包括一个强大的， 定制的，通用的工作 提交基于的Xgrid技术 运行的情况下，界面的Xgrid BLAST， 一个功能齐全，支持网格的 应用NCBI BLAST 局部比对搜索算法工具。

安装Xgrid后，您可以在任何客户端计算机上打开/Applications/Xgrid BLAST.app。

欲了解更多信息，请参见：

• 的Xgrid installation documentation由犹他大学。
• How to use Apple's xgrid for running BLAST jobs由NACS研究计算支持组
• Xgrid basics由Blaxter实验室在爱丁堡大学进化生物学研究所。它包含一个样本Perl file，用于将BLAST作业提交给Xgrid。

最后的技巧，如果你有相关的对未来问题的任何生物信息学，还有对生物信息学家专门针对出现StackOverflow克隆叫BioStars。你可能会在那里得到更快的答案。