在R中合并两个数据帧

我在一个数据帧中有139104行的数据是96x1449的倍数。我有一个表型文件，其中包含96个样本的表型信息。 snp名称重复1449X96个样本。我必须合并基于sid和sen的两个数据框。这是我的两个数据框看起来像在R中合并两个数据帧

dat <- data.frame(
    snpname=rep(letters[1:12],12), 
    sid=rep(1:12,each=12), 
    genotype=rep(c('aa','ab','bb'), 12) 
) 
pheno <- data.frame(
    sen=1:12, 
    disease=rep(c('N','Y'),6), 
    wellid=1:12 
)

我必须合并或添加疾病列和其他3列到数据文件。我无法在R中使用合并。我搜索谷歌，我没有达到正确的条件，得到答案。我很感谢在这个问题上的任何投入。

感谢，沙拉德

来源

2011-05-04 sharad purohit

'DAT < - 合并（DAT，苯氧，by.x = “SID”，由.y =“sen”，all = TRUE）' – Ista 2011-05-04 18:04:40

对于后面的使用，不要错过[snpMatrix]（http://www.bioconductor.org/packages/2.3/bioc/html/snpMatrix.html）存储基因型数据，快速GLM），[snpAssoc]（http://cran.r-project.org/web/packages/SNPassoc/index.html）（用户友好型）或[GenABEL]（http：// www.genabel.org/）软件包。大多数人可以通过[GGtools]（http://www.bioconductor.org/packages/2.2/bioc/html/GGtools.html）建立特定的结构（或环境）来操纵和合并基因型和表型数据。 – chl 2011-05-04 18:39:38

@Ista，下次发帖作为答案。这样，你可以得到一点点奖励。 – 2011-05-04 21:02:43

您可以指定要直接与merge()匹配列：

merge(dat, pheno, by.x = "sid", by.y = "sen")

来源

2011-05-04 18:02:51 Chase

在R中合并两个数据帧

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