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我已经下载了1000G数据集的vcf格式。使用Plink 2.0我已经将它们转换成二进制格式。 现在我需要合并1-22条染色体。 我使用这个脚本:合并染色体Plink
${BIN}plink2 \
--bfile /mnt/jw01-aruk-home01/projects/jia_mtx_gwas_2016/common_files/data/clean/thousand_genomes/from_1000G_web/chr1_1000Gv3 \
--make-bed \
--merge-list /mnt/jw01-aruk-home01/projects/jia_mtx_gwas_2016/common_files/data/clean/thousand_genomes/from_1000G_web/chromosomes_1000Gv3.txt \
--out /mnt/jw01-aruk-home01/projects/jia_mtx_gwas_2016/common_files/data/clean/thousand_genomes/from_1000G_web/all_chrs_1000G_v3 \
--noweb
但是,我得到这个错误
Error: --merge-list only accepts 1 parameter.
的chromosomes_1000Gv3.txt具有这种格式与染色体2-22文件:
chr2_1000Gv3.bed chr2_1000Gv3.bim chr2_1000Gv3.fam
chr3_1000Gv3.bed chr3_1000Gv3.bim chr3_1000Gv3.fam
....
任何建议可能是什么问题?
谢谢