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我有一个问题类似于this question的顶部响应,但没有解决。但是,我通过rpy2包在python中使用ggplot2,这引入了额外的困难。Python中使用ggplot2的分类变量的稳定颜色映射(rpy2)
我有许多不同的时间序列(带有变量名称),我想要在数据序列旁边绘制(这是常量)。我希望数据系列在所有图中都是相同的颜色,但不关心其他系列的颜色。但是,如果允许ggplot2自动分配颜色,则按字母顺序排列,颜色根据序列名称是按字母顺序排列在“数据”之前还是之后,映射不稳定。 (请参阅下面的代码)
请注意,系列名称(代码示例中的'a_model','e_model')并不都是事先已知的,所以我不能简单地创建带有所有可能系列名称的手动色阶。此外,地块可能包含数据系列和多个其他系列。我只关心保持数据系列不变的颜色。
from rpy2 import robjects
from rpy2.robjects.lib import grid
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects.lib.ggplot2 as ggplot2
from rpy2.robjects import pandas2ri
import pandas as pd
pandas2ri.activate()
###Input data###
plot_data={}
plot_data.update({'a_model':[0.217,0.226,0.238,0.253,0.272,0.278,0.283,0.29,0.296,0.298]})
plot_data.update({'data':[0.255,0.226,0.241,0.19,0.264,0.302,0.291,0.26,0.218,0.221]})
plot_data.update({'mos_since_start':[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10]})
###Plotting Function###
def plot(plot_data, filename):
df=pd.DataFrame(in_dict)
fig = pd.melt(df, id_vars=['mos_since_start'])
pp = ggplot2.ggplot(fig) + \
ggplot2.aes_string(x='mos_since_start',
y='value',group='variable',colour='variable', shape = 'variable', linetype = 'variable') +\
ggplot2.geom_line() + ggplot2.geom_point()
robjects.r.ggsave(filename=filename, plot=pp, width =12, height = 8)
###Plots###
plot(plot_data,"./testplot.pdf")
plot_data.update({'e_model':plot_data.pop('a_model')})
plot(plot_data,"./testplot2.pdf")