2017-04-04 70 views
0

我在更大的数据集中执行以下操作时遇到问题。我想知道是否有内置的方法来使用ff或ffdf来完成它。将值重新分配给ffdf中的列[R]

实施例:

require(ffbase) 
> iris 
    Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 
1   5.1   3.5   1.4   0.2  setosa 
2   4.9   3.0   1.4   0.2  setosa 
3   4.7   3.2   1.3   0.2  setosa 
4   4.6   3.1   1.5   0.2  setosa 

#Convert to ff object 
A <- as.ffdf(iris) 

我可以访问“物种”列

A$species 
> A$Species 
ff (open) integer length=150 (150) levels: setosa versicolor virginica 
     [1]  [2]  [3]  [4]  [5]  [6]  [7]  [8]    [143]  [144] 
setosa setosa setosa setosa setosa setosa setosa setosa   : virginica virginica 
    [145]  [146]  [147]  [148]  [149]  [150] 
virginica virginica virginica virginica virginica virginica 

但是,如果我想:使用SUBSTR并重新分配它作为一个不同的列修改字符列在ffdf对象以子字符串1到3,例如,我得到以下错误:

> substr(as.character(A$Species),1,3) 
Error in substr(as.character(A$Species), 1, 3) : 
    extracting substrings from a non-character object 

有什么准则来修改ffdf对象中的列?

编辑

我也尝试了ffdfdply的方法。这似乎需要很长的一个相当小的数据:

substrff <- function(x){ 
    x$new <- substr(x$Species,1,8) 
    return(x) 
} 

B <- ffdfdply(x=A, split = A$Species, FUN = substrff) 

回答

1
require(ffbase) 
data(iris, package = "datasets") 
x <- as.ffdf(iris) 
x$spec <- with(x[c("Species")], substr(Species, 1, 4)) 
+0

谢谢!我不知道“with”或“with.ffdf”的功能是否允许列上的大多数操作? – dleal

+1

with.ffdf将数据以行块形式存储在RAM中(受RAM可用性的限制),然后您可以对指定的列执行任何矢量化操作。 – jwijffels