如何在python中将图像转换为16位zip（放气）压缩的TIF？

我们在服务器中获得了来自工业传感器的50TB 16位无压缩TIF图像，我们希望通过使用python进行无损压缩压缩来压缩它们。使用Python，因为它更容易使用Python来沟通我们的数据库。如何在python中将图像转换为16位zip（放气）压缩的TIF？

但经过几个小时的搜索和文档阅读，我发现甚至没有一个成熟的python库可以将16位TIF转换为zip压缩tif。最新的PIL无法将压缩的tif，OpenCV硬编码的输出文件写入LZW tif not zip（deflate）。并且在smc.freeimage，PythonImageMagick中没有足够的文档，所以我不知道他们是否可以这样做。我也发现这个tifffile.py，在它的源代码中似乎有一些关于压缩的东西，但没有示例代码让我明白如何配置输出压缩选项。

当然，我可以使用外部可执行文件，但我不想在这里使用python作为脚本语言。

所以，如果有人给我一个有效的例子，我真的很感激，谢谢。

更新：

cgohlke的代码工作，在这里我提供了另一种重量轻的解决方案。从这里签出修补过的pythontifflib代码https://github.com/delmic/pylibtiff。

来自谷歌代码的原始PythonTiffLib不能很好地处理RGB信息，它不能处理我的数据，这个修补版本可以工作，但是因为代码很老，这意味着PythonTiffLib可能不能很好地维护。

使用这样的代码：

from libtiff import TIFF 

tif = TIFF.open('Image.tiff', mode='r') 
image = tif.read_image() 

tifw = TIFF.open('testpylibtiff.tiff', mode='w') 
tifw.write_image(image, compression='deflate', write_rgb=True)

来源

2013-09-24 tomriddle_1234

如果你找不到任何专门在Python中完成这项工作的东西，并且有外部可执行文件，当它通过正确的参数时，为你做了正确的工作。那么我认为你应该使用'sys.call'或'subprocess.call'。 –

@ hus787，谢谢，那将是我最后的选择。 –

@ cgohlke，你好，我不认为tifffile可以保存压缩的tiff。我在看旧的Pylibtiff。 –

PythonMagick为我工作在Windows上：

from PythonMagick import Image, CompressionType 
im = Image('tiger-rgb-strip-contig-16.tif') 
im.compressType(CompressionType.ZipCompression) 
im.write("tiger-rgb-strip-contig-16-zip.tif")

Scikit图像包括FreeImage库文件的包装：

import skimage.io._plugins.freeimage_plugin as fi 
im = fi.read('tiger-rgb-strip-contig-16.tif') 
fi.write(im, 'tiger-rgb-strip-contig-16-zip.tif', 
     fi.IO_FLAGS.TIFF_ADOBE_DEFLATE)

或者通过tifffile.py,2013.11.03或更高版本：

from tifffile import imread, imsave 
im = imread('tiger-rgb-strip-contig-16.tif') 
imsave("tiger-rgb-strip-contig-16-zip.tif", im, compress=6)

这些可能不会保留所有其他TIFF标记或属性，但未在问题中指定。

来源

2013-09-24 06:37:50 cgohlke

非常感谢，花了一些时间安装PythonMagick之后，它最终运行得非常好，我没有测试它的速度，但是通过它的依赖关系，我猜PythonMagick会非常高效。 –

添加PythonMagick的下载链接，用于linux http://www.imagemagick.org/download/python/。对于Windows，http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pythonmagick。现在的问题是PythonMagick可能会在群集上安装麻烦 –

如何在python中将图像转换为16位zip（放气）压缩的TIF？

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