SimpleITK选择性地改变像素/切片

我已经在SimpleITK中加载CT扫描。我想在NumPy中做一些非常简单的事情，但还没有想出如何在SimpleITK中完成它们。我希望在SimpleITK中提供速度。SimpleITK选择性地改变像素/切片

# NumPy: Changes all values of 100 to now become 500 
nparr = nparr[nparr == 100] = 500 

# SimpleITK: 
???

SimpleITK图像== 100将产生相同的尺寸，其中所有的强度== 100是1 /真的二进制图像。这是理想的。但我不相信SimpleITK不幸的支持布尔索引。完成这个最有效的方法是什么？

我想出了这个时髦的东西;但我希望能找到预期的方法/最佳实践意味着这样做：

# Cast because data type returned is uint8 otherwise 
difference = 500 - 100 
offset = SimpleITK.Cast(image == 100), sitk.sitkInt32) * difference 
image += offset

来源

2017-03-07 Authman Apatira

您可以使用BinaryTheshold过滤器。

结果= sitk.BinaryThreshold（图像，100，101，500，0）

应当只选择具有强度的像素100

来源

2017-10-02 19:40:24

您正在使用SimpleITK图像对象在numpy的风格来使用它的工作，你需要使用的方法GetArrayFromImage和GetImageFromArray来再通过将imagedata转换为numpy数组来获得像素访问。

import SimpleITK as sitk 

difference = 500 - 100 
img_arr = sitk.GetArrayFromImage(image) 
offset = img_arr[img_arr == 100] * difference 
output = sitk.GetImageFromArray(image += offset)

来源

2017-04-04 18:07:51

我希望有一种方法来sitk内做瓦特/ o转换为numpy，因为许多场合的功能更加优化并且运行速度更快 –

SimpleITK选择性地改变像素/切片

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