在Octave中读取tif文件的问题

我正在尝试使用Octave读取.tif格式的医学影像数据。恰巧只有https://fiji.sc/的软件才有能力读取我拥有的医学影像。我所指的图像样本是this之一。此图片仅在斐济以.tif格式可读。该图像也可以转换为jpg图像。只有在其他图像编辑软件可以看到数据点之后。现在的问题是，我想把它加载到八度并阅读它 - 目前是不可能的。 imshow()函数的倍频程不允许我可视化给定的.tif文件。在Octave中读取tif文件的问题

因此，如果任何人有阅读这种文件格式的经验，请让我知道。谢谢。

来源

2017-08-02 motiur

您链接的图像是一个16位灰度图像，请参阅$ gm identify -verbose hello.tif。所以让我们把它加载到GNU八度：

img = imread ("hello.tif"); 
hist (img(:), 200);   # show histogram

啊！你的形象的主要信息是在范围0-600（可能使用的图像采集系统有11个或12位分辨率）所以让我们的规模和打印此部分为彩色编码（贻贝）形象：

imagesc (img, [0 600]) 
colorbar

这是你想要的吗？当然，我们也可以使用一个灰色的颜色表，请尝试：colormap gray

如果这样仍不能满足你的需要，你真的应该解释一下你希望看到什么....

来源

2017-08-02 09:20:54 Andy

你可能想解释为什么斐济（ ImageJ）默认工作。原因是对于非8位图像，ImageJ仅使用图像的最大值和最小值。人们可以设置其他值，但即使如此，只能在最大值和最小值之间。数据类型的实际限制从不使用。这是有道理的，因为大多数16位图像首先不会来自16位相机。 – carandraug

我感兴趣的是使用滤镜去噪图像。目前我无法使用八度的“imshow（）”。我发现的原因之一是该图像被称为16位编码，但八度只允许显示8位图像。那么有没有使用'imshow（）'的成功方法。 – motiur

@motiur：如上所示，“八度只允许显示8bit的图像”并不是真的。拍摄上述图像的相机具有11位或12位分辨率，存储为16位整数。所以通常将其缩放到0..1的范围内以便进一步处理。如果你只使用没有LIMITS的'imshow'，它将0显示为黑色，2^16-1显示为白色，但由于整数范围是0..2000（请参阅我的直方图），您会看到几乎是黑色的图像。没有魔术在这里 – Andy

在Octave中读取tif文件的问题

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