knitr RStudio编译问题（windows）

我有一个基于knitr的Rnw文件，它在mac（v0.97.316）和knitr（v1.1）上的RStudio中完全正常编译为pdf，但是在windows环境中（相同版本）我收到一个编译错误。我已经在两种环境中检查了RStudio中的选项，并且它们是一致的。knitr RStudio编译问题（windows）

看来，Windows安装程序总是向“.tex”文件注入“\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”，即使我在Rnw文件中没有这样的标志，和/或如果我切换设置在首选项中，和/或如果我将“opts_knit $ set（concordance = FALSE）”选项添加到knitr设置块中。如果我从“.tex”文件中删除该行并在cmd提示符处手动编译该行，则会按预期生成输出。

我不确定这是RStudio还是knitr问题，但任何指针将不胜感激。

请注意，我也在RStudio支持板上发布了这个问题（http://support.rstudio.org/help/discussions/problems/5039-knitr-compile-problems-with-rstudio-windows?unresolve=true）。

来源

2013-02-23 Andy Judson

的原因，它被注入\SweaveOpts{concordance=TRUE}很可能是你的织布工Sweave而不是knitr，你也能RNW一致：http://www.rstudio.com/ide/docs/authoring/rnw_weave但我不能肯定地说，这是不是为Windows版本RStudio的错误。无论如何，这是很容易验证它是否是一个RStudio问题 - 打开Compile PDF面板，你应该看到的日志是这样的：

RStudio with knitr

如果你的织布工Sweave，你会看到这样的事情，而不是：

RStudio with Sweave

这是我的配置（我是在Ubuntu下）：

Configure Sweave in RStudio

如果你确实使用了knitr，并且RStudio仍然插入\SweaveOpts{concordance=TRUE}，我猜它肯定是RStudio的一个bug。

来源

2013-02-23 18:22:40

感谢您的答复，但是是的，我有knitr激活设置，日志的第一部分确认knitr，就是要在使用中。实际上，看起来好像是我没有发现Rnw文件中的行，当我切换环境时必须添加该行。 – 2013-02-24 12:41:44

即使knitr默认设置为“Weave Rnw files using”，我也遇到了同样的问题。

我通过转到工具/全局选项/ Sweave并将“Weave Rnw files using”设置为Sweave并按Ok来解决此问题。然后，我回去把它放回knitr，现在一切正常。

我想这确实是Rstudio错误

来源

2015-04-09 19:16:44 Alby

我遇到了这个问题，“R CMD建立KFAS主”中下载2016年4月24日从KFAS的“KFAS-master.zip”点击“下载ZIP” GitHub（https://github.com/helske/KFAS）。我无法复制该问题，但我使用的工作是找到弹出窗口中提到的行（复制如下），并通过在“%%”前面注释掉它。

下载后，我将其解压缩并将文件夹的名称更改为“KFAS”。然后我得到一个命令提示符并导航到包含KFAS-master文件夹的目录，该文件夹被重命名为KFAS。这次“R CMD build KFAS”按预期工作。然后我在RStudio 0.99.893中打开了〜KFAS/vignettes/KFAS.Rmw，当前版本为2016-04-26。我改变了一些东西并保存了结果。当我重复“R CMD构建KFAS”时，我在下图中看到了问题。

Jouni Helske指示我转到这篇文章。我通过在“\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”前加上“%%”，在下面的屏幕截图中提到了第69行。我保存了结果，“R CMD build KFAS”工作。

某些东西似乎偶尔会将“\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”这样的行插入* .Rnw文件，但我不知道它是什么。我在OS X 10.11.2的MacBook Pro上运行R 3.2.4。

感谢Yihui等人在此主题中的较早发帖。

screen shot showing pop-up complaining, "It seems you are using the Sweave-specific syntax in line(s) 69... ."

来源

2016-04-26 14:44:01

knitr RStudio编译问题（windows）

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