如何计算所有可能行之间的相关性

Question

我在xls中有非常大的数据。它的一小部分被示出在下面

Name V1 V2 V3 V4 V5 
    A 2 2 2 1 2 
    Ab 10 10 9 1 10 
    AC 14 7 1 2 14 
    AD 5 1 1 1 5 
    AF 14 14 11 1 14 
    Ag 3 3 3 1 3 
    Qn 7 7 7 3 7 
    Ah 35 3 3 1 35 

欲行计算相关系数的所有可能的组合 例如，行1和行2，列1和ROW3 ...

输出I希望有这样

Name1 Name2  Correlation Coef 
A  Ab  
A  AC 
.   . 
.   . 
.   . 

我发现这一个，但我无法弄清楚如何使用它 Calculating Pearson correlation and significance in Python

该解决方案是给一个答案，但问题是，我不能让输出我想 http://lilithelina.tumblr.com/post/135265946959/data-analysis-pearson-correlation-python

Answer 1

读你的数据作为大熊猫数据框（比方说，df）。致电df.T.corr().unstack().reset_index()。 .unstack()构建分层索引，.reset_index()将其转换为列，.T将行关联到列。

results = df.T.corr().unstack().reset_index(name="corr") 
print(results) 
# level_0 level_1  corr 
#0 A1L020 A1L020 1.000000 
#1 A1L020 A1X283 0.993933 
#2 A1L020 A2A3N6 0.499363 
#3 A1L020 A2RTX5 0.408248 
#.... 
results.to_csv("some_file.csv")