ggplot2热图：如何保留标签的顺序？

我试图绘制使用以下casbon的解决方案的csv数据GGPLOT2热图中ggplot2热图：如何保留标签的顺序？

问题是X-标签尝试重新排序本身。例如，如果我在该示例数据中交换标签COG0002和COG0001，则x标签仍按排序顺序排列（cog0001，cog0002，cog0003 .... cog0008）。

反正有防止这种情况吗？我想它在csv文件

感谢

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2010-06-07 Tg.

下面有很好的答案。这是一个小心，在研究这个问题时，你可能会遇到'有序因素'。除非你知道你在做什么，否则不要使用它。按照特定的顺序和使用有序因子来设置关卡并不是一回事。例如，有序因素会导致一些建模软件默认为多项式而不是治疗效果。 – John 2010-06-07 15:48:35

如果您想直接从csv文件保持这个顺序：

foomelt$COG <- factor(foomelt$COG, levels = as.character(foo[[1]]))

2010-06-07 14:08:07

在这种情况下不是问题，但是在重复条目的情况下应该有'unique（as.character（foo [[1]]））'。 – Marek 2010-06-07 15:27:55

你尝试绘制之前重新排序因子水平可以订购？例如

foomelt$COG = factor(foomelt$COG,levels(foomelt$COG)[c(2,1,3:8)])

（我不能尝试，现在，所以我不能肯定它的工作原理）

2010-06-07 13:52:35

我不认为我可以手动订购，因为我的数据大约有100多点。 – 2010-06-07 14:34:37

如果我记得，当使用默认级别参数调用factor（x）时，级别设置为levels = sort（unique（x））。

您可以通过设置levels = unique（x）来覆盖此操作。

例如：

set.seed(1) 
x = sample(letters, 100, replace = TRUE) 
head(x, 5)

[1] “G”， “J” “○” “×”， “F”

levels(factor(x))

[1] “A” “B”“C “d”“e”“f”“g”“h”“i”“j”“k”“l”“m”“n”“o”“p”“q”“r”“s”

[20] “T” 的 “u”， “v”， “W” 的 “x” “y” 的 “Z”

levels(factor(x, levels = unique(x)))

[1]“g”“j”“o”“x”“f”“y”“r”“q”“b”“e”“u”“m”“s”“z”“d” “K”， “一个”， “W” 的 “i”

[20] “p”， “v”， “C” 的 “n”， “t” 的 “L”， “H”

可以看到，设置电平= unique（x）保留数据中出现的顺序。

2010-06-07 15:25:56 Greg

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