R：在Debian Lenny上升级Hmisc

当我在EC2上调出Debian Lenny的基本映像（实际上EC2上的EMR）时，我得到了Lenny 5.0.7版本，我可以使用方法outlined in a previous question升级R。升级R后，我有版本2.12。R：在Debian Lenny上升级Hmisc

我一直无法安装Hmisc软件包。我看到它有一个Debian软件包，所以我已经试过：

sudo apt-get update 
sudo apt-get install r-cran-hmisc

这似乎是工作，但是当我进入RI得到如下：

> require(Hmisc) 
Loading required package: Hmisc 
Failed with error: ‘package 'Hmisc' was built before R 2.10.0: please re-install it’

所以我推测Hmisc在Debian repo是一个旧版本。所以我只会升级。于是我去到R和：

... 
gcc -I/usr/share/R/include  -fpic -std=gnu99 -O3 -pipe -g -c string_box.c -o string_box.o 
gfortran -fpic -O3 -pipe -g -c wclosest.f -o wclosest.o 
gcc -shared -o Hmisc.so Hmisc.o cidxcn.o cidxcp.o hoeffd.o jacklins.o largrec.o mChoice.o nstr.o ranksort.o rcorr.o string_box.o wclosest.o -lgfortran -lm -L/usr/lib64/R/lib -lR 
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran 
collect2: ld returned 1 exit status 
make: *** [Hmisc.so] Error 1 
ERROR: compilation failed for package ‘Hmisc’ 
* removing ‘/home/hadoop/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/Hmisc’ 

The downloaded packages are in 
    ‘/tmp/Rtmp2Ej5Tn/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("Hmisc") : 
    installation of package 'Hmisc' had non-zero exit status 
>

它看起来像LD与lgfortran挣扎：

install.packages("Hmisc")

与失败。我检查并安装了gfortran。所以我尝试安装gfortran-4.1：

sudo apt-get install gfortran-4.1

这并没有改变任何东西。也没有安装4.2。

接下来要做什么的任何提示？

来源

2011-01-14 JD Long

我偶然发现this previous question后我张贴在这里。看来我需要手动链接到gfortran库：

sudo ln -s /usr/lib/libgfortran.so.3 /usr/lib/libgfortran.so

更新集群包后，我能够install.packages("Hmisc")

来源

2011-01-14 14:36:20

这看起来不对。 `-dev`包为你做。 – 2011-01-14 16:05:49

当您安装r-base-dev包，会发生什么？它是否构建呢？这应该。

来源

2011-01-14 16:06:14

R：在Debian Lenny上升级Hmisc

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