如何从显微镜上拍摄的图像中分割出细胞，沿着Matlab中完成的操作？在Python中进行细胞分割和荧光计数
http://blogs.mathworks.com/steve/2006/06/02/cell-segmentation/
另外，如果我采取不同的荧光信道的多个图像（有一些抗体/制造者染色细胞后），我怎样才能自动定量细胞的阳性每个标记的级分？有没有人在Python中做过这样的事情？还是有Python中的库可以用来做到这一点？
您可以使用OpenCV库在Python中执行此操作。
特别，你会感兴趣的以下特点：
cv.EqualizeHist）。这是来自当前Python API的missing，但是如果您下载OpenCV的最新SVN版本，则可以使用它。这部分是唯一的，并不需要得到同样的结果cv.Watershed - 它exists，但由于某种原因，我在手册中找不到它）考虑到这一点，这是我会怎么用OpenCV中得到相同的结果MATLAB文章：
cv.FindContoursimextendedmax操作做）我还没有尝试过任何（对不起，现在没有时间），所以我不能告诉你任何代码。然而，根据我对OpenCV的经验，我相信到第7步的所有内容都可以正常工作。我以前从未使用过OpenCV的分水岭转换，但我无法看到它不能在此工作的原因。
尝试执行我已经显示的步骤，并让我们知道您是否有任何问题。一定要张贴您的来源，让更多的人能够帮助您。
最后，要回答您关于染色细胞并量化其存在的问题，知道您正在使用的染料是相当容易的。例如，要确定用红色染料染色的细胞，您需要从图像中提取红色通道并检查高强度区域（可能是通过阈值）。
虽然这个链接可能回答这个问题，但最好在这里包含答案的基本部分，并提供参考链接。如果链接页面更改，则仅链接答案可能会失效。 – 2015-06-06 21:42:29
@AndrewSvetlov感谢哥们...... 4年前你在哪里告诉我们这件事。 – so12311 2015-06-07 01:13:19
而只是为了增加一个：cellprofiler.org（开源的细胞图像分析软件，在python）
不知道如何把这个放下抱，但试图编辑解决（而挑剔的和不正确的）“关主题“标记。 – 2015-06-09 22:22:31
@bluefeet - 为什么关闭？这是一个具体问题，下面有两个具体答案。我编辑了要求推荐的部分。 – 2015-07-12 04:32:26
@thouis这是为什么关闭？因为这个问题太广泛了，而且还要求一个图书馆。您的编辑删除最后一行基本上无效每个答案就这个问题，只是指向一个链接。关闭一个问题并不意味着它会被删除，但是这个写的问题是无关紧要的。 – Taryn 2015-07-13 14:48:07