RStudio中的R编码器：无法设置根目录结构的选项

使用RStudio中的编织按钮对我来说工作起来非常漂亮，可以处理简单文件，自动生成Rmd文件，然后生成PDF。现在我工作的一个大项目，我已经分裂目录RStudio中的R编码器：无法设置根目录结构的选项

MainProjectDir/

MainProjectDir /代码/

MainProjectDir/DataRaw/

MainProjectDir/DataWork/

getwd（）为我提供MainProjectDir路径。 Code目录中的.r文件相互调用，并通过使用MainProjectDir路径中的相对路径来加载和保存数据目录中的数据。

现在，使用针织按钮的代码目录.R文件，当我得到连接错误：

错误的文件（文件名，“R”，编码=编码）：无法打开连接

这里阅读答复少看一辉的页面之后，我尝试设置在knitr包root.dir选项与

knitr :: opts_knit $组（root.dir =“..”）

在按下RStudio中的编织按钮之前在控制台中。我仍然有同样的错误。也尝试了路径的绝对路径版本。我究竟做错了什么？

2016-08-23 claudiu

您是否尝试过使用'rmarkdown :: render'函数？ – YCR

我正在使用File/Knit菜单命令，让RStudio对pandoc/knitr执行调用。适用于简单的目录结构，这就是为什么我试图找到一种方法来正确描述相对路径。你建议的流程是什么？ – claudiu

你有另一个脚本，你在其中使用函数rmarkdown :: render。它可以更好地控制你的环境。最好是用rm（list = ls（））'来清理你的全球环境。 – YCR

找到此解决办法在github讨论线程中的问题，添加至R代码和作品：

如果（基名（getwd（））== “代码”）setwd（normalizePath（ “..”））

张贴这为寻找一个快速的解决方案，但如果有人能解释什么是错的

knitr :: opts_knit $组（root.dir =“..”）

以及如何修复它请发布，我会接受他的答案。

2016-08-23 14:05:26 claudiu

不知道这是否能解决你所有的麻烦，但是你有没有看过Dean Attali的ezknitr包？它给你更多的目录灵活性。

2016-08-23 19:31:51

现在看，它基于该文件包应该确实允许我使用的目录结构。不过，现在我想保留使用RStudio针织按钮和原始R文件而不是Rmd的便利性，以便保持找到丑陋的解决方法。请参阅我写给Gregor上面的建议的评论。如果我只能删除setwd（）... – claudiu

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