没有root权限的R包的系统依赖关系

Question

我正在开发一个具有系统依赖关系（大部分包是用C++）的R包，并且正在寻找分发的最佳实践。我相信没有办法用R软件包来分发系统软件包。似乎这个问题最近在this thread中引起了一些关注。

假设用户没有root权限，并且正在使用R的本地安装。他们在本地获取这些软件包的最佳方式是什么？是否像下载共享库一样简单，并将它们添加到$ R_HOME/Libraries中？或者最好是将它们下载到本地文件夹并设置LD_LIBRARY_PATH？

我对R相当陌生，所以我想知道是否有一个“首选”解决方案，以获得最佳最终用户体验。

Answer 1

如果他们实际上是系统库，只需依赖他们，并可能通过autoconf进行测试。许多CRAN包装都是这样做的。

重新构建共享库的部署方式最好留给操作系统，Linux发行版，系统管理员......而不是用户空间应用程序。

Answer 2

你可以在inst/目录中包含任何你想要的东西，包括lib子目录。如果您只想在运行时访问这些库，则可以使用类似Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH=system.file("lib",package="mypkg"))的设置来相应地设置库路径。

如果您需要在安装/编译时链接库，可能会有点麻烦。我可以想象，你可以设置你的配置脚本和Makefile（R扩展手册第13-15页）来查找正确的位置......但我不知道如何做到这一点，它可能需要一些把玩身边做它（如果你这样做，请记录它！）

注意，包包含二进制文件不允许在CRAN（出于明显的安全原因），虽然R-伪造不会允许他们...

（这个建议没有被测试 - 我已经分发二进制可执行包内，但从来没有图书馆 - 所以我希望这是有益的，或者至少不会产生误导。）

Answer 3

你可能会はnt查看bigmemory包的一种方法 - 它包括一个不重要的子集（16兆价值）的提升。