密度曲线上plotly直方图

我使用plotly绘制一个数据集的直方图我与密度曲线上plotly直方图

test <- data.frame(y = rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054)) 
plot_ly(x = ~test$y, type = "histogram", nbinsx = "23")

情节本身是好的，但我不清楚如何绘制流过一个光滑的密度曲线工作直方图的轮廓。

Plotly reference manual表明，

直方图迹被初始化plot_ly或add_trace：

plot_ly(df, type="histogram"[, ...]) 
add_trace(p, type="histogram"[, ...])

和有我假设将允许用户绘制的密度曲线histnorm (enumerated: "" | "percent" | "probability" | "density" | "probability density") histonorm功能，但我不知道如何使用这个功能。

有兴趣了解别人如何解决这个问题。任何提示或建议非常感谢。

来源

2016-12-28 missy morrow

我不知道如果一个方法可能是'scale'密度，使其上的情节更加清晰。 'test = data.frame（y = rgamma（1000，shape = 0.25，rate = 0.0054））; fit = density（test $ y）; scale = 500/max（fit $ y）; plot_ly（）％>％add_histogram（x =〜test $ y，name =“直方图”）％>％add_lines（x = fit x，y = scale * fit $ y，name =“Density”）' –

@DarshanBaral这很有趣 –

一个选项，如果你比gigplot的API更熟悉，那么最简单的方法就是先用ggplot2创建图。

library(plotly) 
library(ggplot2 
test <- data.frame(y = rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054)) 

p <- ggplot(test, aes(x = y, y = ..density..)) + 
    geom_histogram(fill = "steelblue", bins = 23) + 
    geom_density() 

ggplotly(p)

来源

2016-12-28 21:14:17

我试过ggplot，但我无法抑制密度图产生的y轴值，并显示直方图的频率计数。 –

虽然不理想 - 这里的做到这一点的方法之一。

编辑：更新的y轴限制

library(plotly) 

y <- rgamma(1000, shape = 0.25, rate = 0.0054) 
dens <- data.frame(x = density(y)$x, 
        y = density(y)$y) 

miny <- 0 
maxy <- max(dens$y) 

plot_ly() %>% 
    add_histogram(x = y) %>% 
    add_lines(data = dens, x = ~x, y = ~y, yaxis = "y2", 
      line = list(width = 3)) %>% 
    layout(yaxis2 = list(overlaying = "y", 
         side = "right", 
         range = c(miny, maxy), 
         showgrid = F, 
         zeroline = F))

来源

2016-12-28 21:49:28 royr2

x轴上有一条额外的线可能是由于密度图 –

密度曲线上plotly直方图

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