threading.h：10：24：致命错误安装错误

相当无知的linux（ubuntu 14.04）用户在这里。我试图安装一个名为Bowtie2的生物信息学程序 - 我得到这个错误，并不确定它来自哪里。他们在他们的网站上引用了这个可能与它有关的东西，但没有提及它作为依赖。threading.h：10：24：致命错误安装错误

TBB现在是默认的线程库。我们一直发现TBB为可提供卓越的线程缩放。它被广泛使用并广泛安装在中。也就是说，我们还保留了一个与旧版本不同的“旧版”Bowtie，它不使用TBB。要在传统模式下编译 Bowtie源代码，请使用NO_TBB = 1。要使用旧版二进制文件，要在名称中下载带有“legacy”的相应二进制存档文件。

[email protected]:~/Program_Files/bowtie-1.2$ make 
g++ -w -O3 -m64 -DCOMPILER_OPTIONS="\"-O3 -m64 -Wl,--hash-style=both -DWITH_TBB -DPOPCNT_CAPABILITY -DNO_SPINLOCK -DWITH_QUEUELOCK=1 \"" -Wl,--hash-style=both -DWITH_TBB -DPOPCNT_CAPABILITY -DNO_SPINLOCK -DWITH_QUEUELOCK=1 \ 
    -fno-strict-aliasing -DBOWTIE_VERSION="\"`cat VERSION`\"" -DBUILD_HOST="\"`hostname`\"" -DBUILD_TIME="\"`date`\"" -DCOMPILER_VERSION="\"`g++ -w -v 2>&1 | tail -1`\"" -D_LARGEFILE_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_GNU_SOURCE -DPREFETCH_LOCALITY=2 -DBOWTIE_MM -DBOWTIE_SHARED_MEM -DNDEBUG -Wall \ 
    -I SeqAn-1.1 -I third_party -I third_party \ 
    -o bowtie-build-s ebwt_build.cpp \ 
    ccnt_lut.cpp ref_read.cpp alphabet.cpp shmem.cpp edit.cpp ebwt.cpp bowtie_build_main.cpp \ 
    -lpthread -ltbb -ltbbmalloc_proxy 
In file included from pat.h:17:0, 
       from sequence_io.h:12, 
       from multikey_qsort.h:8, 
       from diff_sample.h:8, 
       from blockwise_sa.h:13, 
       from ebwt.h:27, 
       from ebwt_build.cpp:11: 
threading.h:10:24: fatal error: tbb/mutex.h: No such file or directory 
compilation terminated. 
Makefile:259: recipe for target 'bowtie-build-s' failed 
make: *** [bowtie-build-s] Error 1

任何想法的问题可能是什么？

谢谢

来源

2017-02-03 sahwahn

入住此[链接]（http://stackoverflow.com/a/5154174/ 2681245） – Rocoder

我不知道来自互斥体，但如果你想要bowtie2，你不应该编辑bowtie-1.2。最新版本是[2.3]（http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml）。对于未知的，我建议下载预编译的二进制文件，或点击bioconda链接 – heathobrien

您可能需要安装包TBB开发包，例如， libtbb-dev。

在Ubuntu上运行sudo apt-get install libtbb-dev

来源

2017-02-03 16:54:42 cfromme

命令和apt-get安装libtbb-dev的

使

来源

2017-10-13 11:43:04 Snijesh

threading.h：10：24：致命错误安装错误

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