无法使用SQL和ODBC连接将R数据帧保存到filemaker Pro数据库

我有一个Filemaker Pro 12关系数据库，用于接受手术治疗的肺癌患者。由于一名患者可能在一次或多次手术中切除了一个或多个癌症等，因此患者特征/人口统计数据在一张表格（患者）中，他们手术的患者在另一张表格（治疗）中，患者ID和癌症特征在由PatientID确定的另一个表格（病理学）中，但是通过手术表的SurgeryID与癌症被去除相关联。无法使用SQL和ODBC连接将R数据帧保存到filemaker Pro数据库

我想将所有“内部加入”数据备份为一个平面文件，每个不同癌症的记录以及每位患者的每项手术（因此如果患者有多个癌症和/或操作）。

con = odbcConnect("LC", uid = "uid", pwd = "pwd") 
PatSurg <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Treatment T ON P.PatientID = T.PatientID")) 
PatPath <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Pathology H ON P.PatientID = H.PatientID")) 
Full <- merge(PatSurg, PatPath, by = intersect(names(PatSurg), names(PatPath))) 
View(Full)

这成功地创建的数据帧（全部）完全一样的平坦平面文件我想保存到一个空的现有的Filemaker：

我已经使用因此进口3个的Filemaker表病人，治疗，病理学Pro数据库与表胸相同的列名称。

我当时想我会尝试简单的指令：

sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

，并返回错误：

Error in sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic") : table ‘Thoracic’ already exists

气馁，我放弃了表名，并重新保存它：

sqlDrop(con, "Thoracic", errors = FALSE) 
sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

其中返回了一个新的错误：

Error in sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic") : [RODBC] Failed exec in Update HY000 502 [FileMaker][FileMaker] (502): Field failed numeric value validation test

然后我想，也许我应该使用sqlQuery命令和INSERT，但不知道如何在SQL/ODBC表达式时引用我的R数据框。我想：

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic ", Full) 
sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES", Full)

两个返回：

Error in if (errors) return(odbcGetErrMsg(channel)) else return(invisible(stat)) : argument is not interpretable as logical In addition: Warning message: In if (errors) return(odbcGetErrMsg(channel)) else return(invisible(stat)) : the condition has length > 1 and only the first element will be used

sqlAppendTable(con, "Thoracic", Full)

Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘sqlAppendTable’ for signature ‘"RODBC"’

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES Full")

[1] "42000 8310 [FileMaker][FileMaker] FQL0001/(1:29): There is an error in the syntax of the query." [2] "[RODBC] ERROR: Could not SQLExecDirect 'INSERT INTO Thoracic VALUES Full'"

我应该如何在SQL查询中引用我的R数据框“Full”。我所看到的所有问题都只涉及将数据从OBDC源导入数据框。这是最简单的一点！

来源

2017-09-06 Gav

我已经发现了明显的解决方法

我已经安装WriteXLS和导出的数据帧到XLSX文件，然后简单地使用第一行作为列名的输入：

install.packages("WriteXLS") 
library(WriteXLS) 
WriteXLS(Full, "SQL Backup.xlsx")

然后使用导入Filemaker Pro的功能。无论原始格式如何，包含某些字符的自由文本都存在一些问题，并且所有返回的格式都是yyyy-mm-dd格式。主要问题是，如果自由文本包含分隔符，则可能会出现行内右移帧，因此应该是最后一列。我刚纠正XLSX文件中的那些文件，并根据PatientID，SurgeryID和DiagnosisID重新导入为更新。

Addit：实际上，我发现导出为.csv可以纠正这些小问题。

来源

2017-09-07 12:04:03 Gav

无法使用SQL和ODBC连接将R数据帧保存到filemaker Pro数据库

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