插入符号和闪亮符号：无法创建由插入符号模式驱动的预测应用程序

我试图开发一个简单的应用程序，用于预测在给定某个年龄，班级，票价等的情况下乘客幸存泰坦尼克号的概率。我希望这些变量是动态的，并且希望使用底层脱字符模型计算预测的生存概率。插入符号和闪亮符号：无法创建由插入符号模式驱动的预测应用程序

当运行这段代码，我收到以下错误信息：

Warning: Error in [.data.frame: undefined columns selected Stack trace (innermost first): 70: [.data.frame 69: [ 68: sweep 67: predict.preProcess 66: predict 65: probFunction 64: predict.train 63: predict 62: predict 61: is.data.frame 60: data.matrix 59: observerFunc [#17] 4: 3: do.call 2: print.shiny.appobj 1: ERROR: [on_request_read] connection reset by peer

我的代码如下。任何想法是什么导致这个错误？非常感谢。

require(shiny) 
require(plyr) 
require(dplyr) 
require(ggplot2) 
require(caret) 
require(xgboost) 

require(titanic) 
df=na.omit(titanic_train) 
y=data.matrix(select(df, Survived)) 
y[y==0]="N" 
y[y==1]="Y" 
x=data.matrix(select(df, Pclass, Age, SibSp, Parch, Fare)) 

tCtrl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 3, repeats=3, summaryFunction = twoClassSummary, verbose=TRUE, classProbs = TRUE) 
fit_xgbTree= train(x, y, method = "xgbTree" , family= "binomial", trControl = tCtrl, metric = "ROC", preProc = c("center", "scale")) 

ui = pageWithSidebar(
    headerPanel("Titanic"), 
    sidebarPanel(
    radioButtons("Pclass", "Passenger Class", choices=c("1", "2", "3"),selected = "1", inline = TRUE,width = NULL), 
    sliderInput("Age", "Passenger Age", min=0, max=80, value=30), 
    radioButtons("SibSp", "SibSp", choices=c("0", "1", "2", "3", "4", "5")), 
    radioButtons("Parch", "Parch", choices=c("0", "1", "2", "3", "4", "5", "6")), 
    sliderInput("Fare", "Passenger Fare", min=0, max=520, value=35) 
), 
    mainPanel(
    dataTableOutput('testTable'), 
    textOutput('outputBox') 
) 
) 

server=function(input, output){ 

    values <- reactiveValues() 

    newEntry <- observe({ # use observe pattern 

    x=as.data.frame(matrix(0, nrow=1, ncol=5)) 
    colnames(x)=c("Pclass", "Age", "SibSp", "Parch", "Fare") 

    x[1,1]=as.numeric(input$Pclass) 
    x[1,2]=input$Age 
    x[1,3]=as.numeric(input$SibSp) 
    x[1,4]=as.numeric(input$Parch) 
    x[1,5]=input$Fare 


    pred <- data.matrix(predict(object=fit_xgbTree, x, type="prob")[,2]) 
    isolate(values$df <- x) 
    #isolate(values$df2 <- x) 
    }) 

    output$testTable <- renderDataTable({values$df}) 
} 

shinyApp(ui=ui, server=server)

来源

2016-12-16 user3725021

我相信它可能有是由NA导致的...在'x [1,1] = as.numeric（输入$ Pclass）'中，由于输入$ PClass是选择“1st”，“2nd”，“3rd”，所以通过运行'as.numeric'来获得NAs。预测功能失败。所以你不会得到预测函数返回的矩阵，也不能运行'[，2]'。 – Jean

Pclass是数字。你可以通过运行唯一的（df $ Pclass） – user3725021

'input $ Pclass'来检查这个字符。 – Jean

在服务器下面的修改工作非常适合我（加上一个生存概率列，我想这就是你想要的）：

server=function(input, output){ 

    values <- reactiveValues() 

    newEntry <- observe({ # use observe pattern 

    x=as.data.frame(matrix(0, nrow=1, ncol=6)) 
    colnames(x)=c("Pclass", "Age", "SibSp", "Parch", "Fare", "SurvProb") 

    x[1,1]=as.numeric(input$Pclass) 
    x[1,2]=input$Age 
    x[1,3]=as.numeric(input$SibSp) 
    x[1,4]=as.numeric(input$Parch) 
    x[1,5]=input$Fare 

    pred <- data.matrix(predict(object=fit_xgbTree, x[-length(x)], type="prob")[,2]) 
    x[1,6] <- round(pred,2) 

    isolate(values$df <- x) 
    #isolate(values$df2 <- x) 
    }) 

    output$testTable <- renderDataTable({values$df}) 
}

与输出

来源

2016-12-16 06:41:50

插入符号和闪亮符号：无法创建由插入符号模式驱动的预测应用程序

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