我想将Python 2.6嵌入到MATLAB(7.12)中。我想嵌入用C语言编写的mex文件。这对使用标量的简单示例很有用。但是,如果Numpy(1.6.1)被导入无论如何MATLAB崩溃。我说反正因为我已经尝试了多种方式来加载numpy的库,包括在MATLAB中嵌入Python
在Python模块(的.py):
from numpy import *
随着在MEX文件
PyRun_SimpleString
:PyRun_SimpleString(“from numpy import *”);
调用numpy的功能与
Py_oBject_CallObject
:pOut = PyObject_CallObject(pFunc, pArgs);
本来,我认为这可能与C.然而嵌入numpy的一个问题,嵌入在从与/ MD(多线程)开关的命令行与Visual编译简单的C文件时numpy的正常工作Studios 2005 C编译器。接下来,我想我只是改变MATLAB中的make文件来包含/ MD开关。没有这样的运气,mexopts.bat用/ MD开关编译。我还在Numpy init模块中手动注释了行,以查找什么是崩溃的MATLAB。似乎用扩展名pyd加载任何文件崩溃MATLAB。在NumPy中加载的第一个这样的文件是multiarray.pyd。 MATLAB文档介绍了如何使用可视化工作室调试mex文件,并将错误信息放在下面。在这一点上,我知道这个问题是pyd的一个记忆问题,和一些与MATLAB的冲突。有趣的是,我可以在MATLAB中使用系统命令来启动使用numpy的python中的进程,并且不会生成错误。我将在MATLAB下面贴上错误消息,然后在崩溃MATLAB过程的视觉工作室中输出DEBUG。然而,我并没有把整件事情粘在一起,因为首次机会例外的列表非常长。有没有解决这个集成问题的建议?
MATLAB error
Matlab has encountered an internal problem and needs to close
MATLAB crash file:C:\Users\pml355\AppData\Local\Temp\matlab_crash_dump.3484-1:
------------------------------------------------------------------------
Segmentation violation detected at Tue Oct 18 12:19:03 2011
------------------------------------------------------------------------
Configuration:
Crash Decoding : Disabled
Default Encoding: windows-1252
MATLAB License : 163857
MATLAB Root : C:\Program Files\MATLAB\R2011a
MATLAB Version : 7.12.0.635 (R2011a)
Operating System: Microsoft Windows 7
Processor ID : x86 Family 6 Model 7 Stepping 10, GenuineIntel
Virtual Machine : Java 1.6.0_17-b04 with Sun Microsystems Inc. Java HotSpot(TM) Client VM mixed mode
Window System : Version 6.1 (Build 7600)
Fault Count: 1
Abnormal termination:
Segmentation violation
Register State (from fault):
EAX = 00000001 EBX = 69c38c20
ECX = 00000001 EDX = 24ae1da8
ESP = 0088af0c EBP = 0088af44
ESI = 69c38c20 EDI = 24ae1da0
EIP = 69b93d31 EFL = 00010202
CS = 0000001b DS = 00000023 SS = 00000023
ES = 00000023 FS = 0000003b GS = 00000000
Stack Trace (from fault):
[ 0] 0x69b93d31 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00081201 (???+000000)
[ 1] 0x69bfead4 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00518868 (???+000000)
[ 2] 0x69c08039 C:/Python26/Lib/site-packages/numpy/core/multiarray.pyd+00557113 (???+000000)
[ 3] 0x08692b09 C:/Python26/python26.dll+00076553 (PyEval_EvalFrameEx+007833)
[ 4] 0x08690adf C:/Python26/python26.dll+00068319 (PyEval_EvalCodeEx+002255)
This error was detected while a MEX-file was running. If the MEX-file
is not an official MathWorks function, please examine its source code
for errors. Please consult the External Interfaces Guide for information
on debugging MEX-files.
If this problem is reproducible, please submit a Service Request via:
http://www.mathworks.com/support/contact_us/
A technical support engineer might contact you with further information.
Thank you for your help.
从视觉工作室调试器输出
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x0c12c128 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0x00000004.
First-chance exception at 0x751d9673 in MATLAB.exe: Microsoft C++ exception: jitCgFailedException at memory location 0x00c3e210..
First-chance exception at 0x751d9673 in MATLAB.exe: Microsoft C++ exception: jitCgFailedException at memory location 0x00c3e400..
First-chance exception at 0x69b93d31 in MATLAB.exe: 0xC0000005: Access violation writing location 0x00000001.
> throw_segv_longjmp_seh_filter()
throw_segv_longjmp_seh_filter(): invoking THROW_SEGV_LONGJMP SEH filter
> mnUnhandledWindowsExceptionFilter()
MATLAB.exe has triggered a breakpoint
这可能不是一个简单的追踪。一个可能的原因是与加载多个C运行时库有冲突(一个用于Python,一个用于Matlab,可能还有一个用于Numpy)。第一个建议:你说任何.pyd文件崩溃。你尝试过不是来自Numpy的吗?第一步就是让这个基本部分工作,并且只有在努力使Numpy(这更复杂)才能工作之后。(如果解决这个问题太多了,计划B将在单独的进程中运行Python,并使用一些IPC方法与Matlab进行通信。) –
好点。你提到的第一个选项是在.pyd线程之后。但是,这可能涉及检查并可能重写C编译的pyd文件。它需要一行代码来在MATLAB中保存一个.mat文件(保存'data','variable','-v7')(必须保存为与Python兼容的早期格式)和一行代码来读取它Python(变量= loadmat('data.mat'))与Scipy包(来自scipy.io import loadmat)。此外,似乎有更多关于在Python中封装MATLAB函数的文章,这是我将尝试的。 –
我想说,避免嵌入是更好的过程。几年前,我写了一个MEX文件,将Matlab嵌入到Matlab中,并使所有的工作都能正常工作。 (尽管这是在Unix上,谷歌“pythoncall”)。加载二进制Python模块(.pyd/.so)也存在问题,但有些工作可以解决。然而,它并没有与下一个Matlab版本一起工作---总体而言,感觉像一个非常脆弱的设置。 –