绘图 - R中的Pch和rep功能

我已经在我设置的实验中完成了生物丰度的生物丰度的NMDS。我主要有3类，我用我的NMDS，为了简单起见，我们可以叫它A，B和C绘图 - R中的Pch和rep功能

一个拥有36项
B有35项
C有36个条目

我对NMDS没有任何问题，并且可以得到一个很棒的黑白图，这对于发布来说是不错的。我的问题是，在会议上（或海报）的演示文稿中，我想着色点以增加图片的色彩。我正在使用“rep（）”函数，因为我正在为我的类别分配符号（并希望在不久的将来会有颜色）。正如您在此处看到的，我可以得到纯色的点，但我认为黑色轮廓真的会让他们脱颖而出。

我曾尝试将“bg =”和“col =”放在我的代码中有意义的地方，但我无法获得边界的工作。我错过了一些简单的东西吗以下是代码和目前为止的图。 NMDS plot

plot(Ulv.mds, type="n") 
points(Ulv.mds$points, pch=c(rep(17, 36), rep(19, 35), rep(15, 36)), 
    cex=1.1, col=c(rep("black", 36), rep("darkorange3", 35), 
    rep("purple1", 36)))

这是我的第一个问题，请让我知道，如果你需要的任何其他信息，并在此先感谢。

来源

2015-10-19 Travis Foster

情节您最初的点略大，全黑的，然后做在上面的色彩。至少有一种方法可以解决它。即。第一'cex'是1.25，你的第二个将是1.1。 – Badger

如果你想使用背景bg选项，你必须使用pch 21到25.这样，你得到你需要的边框。在他下面的例子中，我选择颜色2：6作为背景，但是你可以使用rep的公式。

plot(1:5, pch=21:25, bg=2:6, cex=2)

来源

2015-10-19 21:37:22

哦，这是小细节.....非常感谢我已经找到了使用rep（）函数。我的新代码是这样的：points（Ulv.mds $ points，pch = c（rep（17,36），rep（21,35），rep（22,36）），cex = 1.1，col = c（rep “black”，36），rep（“black”，35），rep（“black”，36）），bg = c（rep（“black”，36），rep（“darkorange3”，35） “purple”，36））） –

要明确一点：在你的代码中，你正在使用'pch' 17,19和15.这是这个点的形状。不幸的是，这些观点不接受背景。相反，您可以使用：21（圆形），22（方形），23（圆形），24（向上三角形）或25（向下三角形）。 –

绘图 - R中的Pch和rep功能

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