如何更改R CMD Sweave的输出目录？

使用R CMD Sweave我的.tex文件总是在我的HOME目录中生成。有没有可能改变这一点？我的意思是我可以用一个shell脚本的MV，但我想可以去看一些更好的把戏做如何更改R CMD Sweave的输出目录？

@Dirk：我使用的是贴here和pdflatex没有找到该文件，因为它总是写剧本到我的用户的HOME目录。

2010-08-18 Matt Bannert

所以这里是我的工作...... R CMD Sweave没有参数，但仍然是一个解决方法。使用basename和dirname帮了很多:)

#!/bin/bash 

myfile=$(/usr/bin/osascript << EOT 
tell app "AppleScript Runner" 
activate 
    return posix path of (choose file) 
    end 
    EOT) 

    if [ $? -eq 0 ] 
    then 
     echo $myfile 
     R CMD Sweave $myfile 
     no_ext=`basename $myfile .Rnw` 
     directory=`dirname $myfile` 
     mv ~/$no_ext.tex $directory/$no_ext.tex 
     /usr/local/texlive/2009/bin/universal-darwin/pdflatex -output-directory  $directory $no_ext.tex 
     open $directory/$no_ext.pdf 
     else 
      echo "User canceled" 
      fi

来源

2010-08-18 15:10:47

@Dirk，这很奇怪，因为在我的R代码中我从来没有使用HOME作为wd。 – 2010-08-18 15:12:16

我第一次甚至能够使这个代码与platypus一起工作。 – 2010-08-18 15:15:53

咦？它总是在当前工作目录。因此，尝试

mkdir foo 
mv whatever.Rnw foo 
cd foo 
R CMD Sweave whatever.Rnw

和whatever.tex现在将~/foo，因为这是你）把源和b）调用的命令。

来源

2010-08-18 13:52:43

只是编辑我的问题，指向链接中的脚本。脚本打开一个对话框，我可以选择.Rnw文件（Mac OSX）。 – 2010-08-18 14:01:14

然后，您可能会遇到a）该脚本和/或您的路径出现问题，并且b）由于“R CMD Sweave”没有出错，这是一个特别恶劣的问题。 – 2010-08-18 14:03:03

我不是怪'R CMD Sweave' :)。尽管如果有输出目录的参数，我可以使用它来代替文件。事实上，问题是$ myfile是从osascript返回的整个posix路径，我无法正确分割它。但我必须分手的唯一原因是因为我需要周围的事情（因为R CMD）。 – 2010-08-18 14:38:38

如何更改R CMD Sweave的输出目录？

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