R：Read.table难度与不完整制表符已删除数据

我在R中的read.table函数有一个问题。我知道这可能是一个常见问题，但彻底搜索这个论坛和Web一般没有帮助我修复它。我有一个.txt文件，由253列和458800行组成，由制表符分隔。我想使用此代码读取到R：R：Read.table难度与不完整制表符已删除数据

>data<-read.table("file.txt, header=TRUE,nrows=100,sep="\t") 

>names<-colnames(data) 

>classes<-sapply(data[1,],class) 

>data<-read.table("file.txt",colClasses=classes,col.names=names,header=TRUE,nrows=460000,sep="\t",fill=TRUE)

然而，当我使用九月=“\ t”的说法，R跳过大约一半的排随机，只加载24万行，如果我不” t使用sep =“\ t”参数加载所有行，但列不正确。它也给出了一个警告消息，指出col.names中的列数与头中的头数不匹配= TRUE

我认为问题可能是在.txt文件中有些字段是空白的，这些字段是刚刚空的，所以没有空格，NA或任何东西，例如：

field1的 “\ t” 的FIELD2 “\ t” 的 “\ t” 的字段4 “\ t” 的（场3是空的）

我从第三方那里得到了这个文件，并没有对它进行任何修改。任何人都可以帮我解决这个问题吗？

由于提前，

添

来源

2014-07-22 Tim.R

你试过用'read.delim'吗？我不知道如何处理空的领域，但你可以试试看。 –

也可以看一下'read.delim'中的'fill'参数，如果指定'fill = TRUE'，可能会有效。 –

不幸的是，我已经尝试了填充参数，它改变了列，但他们仍然是错误的。 –

您是否尝试过包data.table？它有一个检测分隔符的方法fread。你可以尝试这样：

library(data.table) 
data<-fread("file.txt)

让我知道这是否有帮助。

谢谢

来源

2014-12-16 15:20:09 Nikos

R：Read.table难度与不完整制表符已删除数据

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