Recenter heatmap.2 in R

Question

我使用下面的代码来生成使用heatmap.2的热图.R键=“F”在顶部删除了颜色键。但是，情节不会在原先由颜色键占据的地方留下空白空间。如何通过摆脱顶部的空白空间来重新定位情节？

dImp_heatmap <- heatmap.2(dSet_matrix, Rowv=NA, Colv=NA, col = cm.colors(20), dendrogram="none",trace="none", key="F",margins=c(1,8),colsep=c(1:6),rowsep=(1:62),sepwidth=c(0.05,0.05), sepcolor="white", cellnote=round(dSet_matrix,digits=2),notecol="black",notecex=0.7,scale="column") 

Answer 1

如果你仔细阅读?heatplot.2的文档，你会在参数列表的底部看到以下内容：

lmat，lhei，lwid可视布局：位置矩阵，柱高， 列宽。详情请参阅以下

，详情：

这种布局可以通过 lmat，lwid和lhei specifiying适当的值被重写。 lmat控制每个 元素的相对位置，而lwid控制列宽度，lhei控制行高度。有关如何使用 这些参数的详细信息，请参阅帮助页面的布局。

因此，例如：

data(mtcars) 
x <- as.matrix(mtcars) 
rc <- rainbow(nrow(x), start=0, end=.3) 
cc <- rainbow(ncol(x), start=0, end=.3) 

## 
## demonstrate the effect of row and column dendrogram options 
## 
gplots:::heatmap.2(x,key = FALSE,dendrogram = "row",lhei = c(0.05,0.95)) 

和我想象中的设置lwid将行为类似。虽然我应该补充说明，如果您包含两个树形图，那么左上角的空间对于为树形图绘制空间是必要的。