内存错误的Python在Windows上处理大型数据库

当我Pycharm 4运行此我得到这个代码中的错误：内存错误的Python在Windows上处理大型数据库

PDBSumWWW = urllib.urlopen("https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/data/seqdata.dat") 
PDBSum = PDBSumWWW.read().splitlines() 
PDBSumWWW.close()

这是错误消息：

回溯（最近调用最后一个）：文件“C：/Users/LuisAlberto/PycharmProjects/MSc/SeqPDBSumIRIndex.py”，第98行， main（）文件“C：/Users/LuisAlberto/PycharmProjects/MSc/SeqPDBSumIRIndex.py”，第40行，主 PDBSum = PDBSumWWW.read（）。splitline s（） MemoryError

但是，当在Macbook Air上运行时，它不会发生。

我该如何克服这一点？

来源

2015-10-14 Luis Alarcon

在链接资源中的数据的大小为56056571个字节（〜56 MB）中，'MemoryError'最有可能表明，在运行Windows的计算机没有足够的内存来处理现有的数据（而在MacBook空气）。 –

当然。我如何解决这个问题是因为windows笔记本电脑的规格比Mac书更好的规格Air –

“更好的规格”一般并不意味着你的程序获得更多的内存。挖掘您的系统规格，了解默认情况下进程获得多少内存。如果可以，重新配置它。在MacBook上检查相同，只是为了确保。 – Prune

这是我能想到解决您的问题的最简单的解决方案。
在此解决方案中，for循环将遍历数据库中的每一行。每条线将被分配line变量。

PDBSumWWW = urllib.urlopen("https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/data/seqdata.dat") 
for line in PDBSumWWW: 
    # Do necessary calculations. 
PDBSumWWW.close()

来源

2015-10-14 21:11:57 HackinGuy

谢谢你的帮助。它有助于加速这个过程！ –

内存错误的Python在Windows上处理大型数据库

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