如何同时产生R中

Question

热地图中删除CSEP /非数字的错误，我有一个看起来像这样的数据：

            Cluster_Combined Cluster_1 Cluster_2 Cluster_3 Cluster_4 Cluster_6 Cluster_10 
G-protein coupled receptor signaling pathway (15)    2   6   0   4   3   1   0 
GTP catabolic process (69)          1   0   0   0   2   0   0 
activin receptor signaling pathway (17)       0   2   0   0   0   0   0 
acute inflammatory response (7)         2   1   0   0   1   0   0 
acute-phase response (8)           5   2   1   0   2   0   0 
aging (5)              2   1   2   0   1   0   1 

，我想创建热图，基于上述值，其中的列是指集群名称并将本体术语排列。

现在我有以下

library(gplots); 
dat <- read.table("http://dpaste.com/1505883/plain/",sep="\t",header=T); 
hmcols <- rev(redgreen(2750)); 
heatmap.2(as.matrix(dat),scale="row",cols=hmcols,trace="none",dendrogram="none",keysize=1); 

代码虽然它产生的情节，它给了我下面的错误：

Error in csep + 0.5 : non-numeric argument to binary operator 

此外，我不能看到红 - 绿效果情节。

如何删除错误？

Answer 1

heatmap.2(...)没有“cols =”参数。尝试col=hmcols。

heatmap.2(as.matrix(dat),scale="row",col=hmcols,trace="none",dendrogram="none",keysize=1)