使用AWK从选项卡分隔的文件中提取一列

Question

我知道这是一个简单的问题，但awk命令实际上正在融化我的大脑。我有一个选项卡分隔文件“inputfile.gtf”，我需要从中提取一列，并将它放到一个新文件“newfile.tsv”中，我不能在我的生活中找出正确的语法来使用awk进行此操作。以下是我已经试过：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

也

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

这些都只是给我一个空文件。在我搜索的任何地方，人们似乎都有完全不同的方式去完成这个简单的任务，而在这一点上，我完全迷失了方向。任何帮助将不胜感激。谢谢。

Answer 1

您已经指定了错误的分隔符/t，该标签字符类型为\t：

awk 'BEGIN{ FS=OFS="\t" }{ print $8 }' inputfile.gtf > newfile.tsv 

Answer 2

为什么不能简单：

awk -F'\t' '{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

Answer 3

你命令：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

您在设置-F,这不是必需的，因为您的文件不是用逗号分隔的,。

接下来，OFS="/t"：语法不正确，应该是OFS="\t"，但你又不需要这个，你不想来设置输出字段分隔为\t因为你只打印单个记录和OFS是根本不参与这个案件;除非您打印至少两个字段。

你第二命令：

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

同样它不是/t应该\t。此外FS="\t"类似于-F "\t"

你真正需要的是：

awk -F"\t" '{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

或

awk -v FS="\t" '{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv 

而如果你的文件刚刚tabs和你的字段没有空格之间那么你可以简单地使用：

awk '{print $8}' inputfile.gtf > newfile.tsv