1. 首页
  2. 问答
  3. Bioconductor vs CRAN

Bioconductor vs CRAN

2016-04-24 54 views
2

今天我发现除CPAN外还有另一个存储库。这个存储库是Bioconductor。到目前为止，我注意到Bioconductor的installation过程与经典CRAN的install.packages()略有不同。当我想使用Bioconductor的一些软件包时，我应该担心吗？是否有可能进入一些依赖关系问题（例如，当你在混合，例如ubuntu/debian仓库等）？我在问，因为this说：Bioconductor vs CRAN

If you dont mind using bioconductor packages, then, You can use...

Bioconductor或潜在的另一个存储库有什么问题？

来源

2016-04-24 Wakan Tanka

+3

请澄清，为什么我得到downwote，谢谢 –

+3

很好的问题，但离题外国际海事组织。 bioc或任何公共回购将具有与cran相同的优点和缺点。我会判断包/作者本身，因为在cran和bioc上都有很多垃圾。我认为你误解了arun的评论，因为“bioconductor是一个有风险的回购，使用时有风险”，我认为他并不是暗示的 – rawr

+1

在链接问题中，我特别要求基础，推荐或CRAN可用模块。这就是为什么Arun包括这个评论。为什么我需要限制任何代码的来源在这里并不重要。如果你可以使用Bioconductor软件包，那就去做吧。 –

回答

5

BioConductor结构良好，经过测试和操作。没有什么问题。请自己阅读。

并请在那里了解几乎不限制您可以使用的不同存储库的数量。 'Base R'已经知道CRAN，BioConductor和OmegaHat（虽然我不确定它现在有多活跃，但它也有一个值得骄傲的15年历史）。

最后，你easily build/host/use your own repositories using drat。

来源

2016-04-24 22:14:26

相关问题

 相关问题