2017-10-09 50 views
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我的Python代码是:SimpleITK ::错误:错误的给药子进程:没有这样的文件或目录]

import SimpleITK as sitk 
resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), \ 
         sitk.ReadImage("movingImage.nii"), \ 
         "translation") 
sitk.Show(resultImage, 'test', debugOn=True) 

我得到这个错误:

Traceback (most recent call last):

File "/home/faps/PycharmProjects/Rigid Registration/code.py", line 5, in <'module> sitk.Show(resultImage, 'test', debugOn=True)

File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/SimpleITK-1.0.1rc1.dev333+gabf92-py2.7-linux-x86_64.egg/SimpleITK/SimpleITK.py", line 7741, in Show return _SimpleITK.Show(*args, **kwargs)

RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Show: /media/faps/ECF664A5F664722E/SimpleElastix/Code/IO/src/sitkShow.cxx:515: sitk::ERROR: Error in administrating child process: [No such file or directory]

我在Ubuntu工作与Pycharm 16.04。

我的ImageJ在此地址:/媒体/ FAPS/ECF664A5F664722E

sitk.Show(...是cousing这个错误有谁能告诉我这是什么错误的手段和我怎么样可以解决它?

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SimpleITK,默认情况下,使用ImageJ的显示图像。似乎无法找到ImageJ。 debugOn标志应该使SimpleITK打印出它用来查找ImageJ的搜索路径,但我不会在错误消息中出现。 –

回答

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正如我的评论所说,SimpleITK似乎无法找到ImageJ。在Linux系统上,搜索路径包括当前工作目录$ {HOME}/bin,/ opt和/ usr/local。

如果您的ImageJ可执行文件位于另一个位置,或者如果您想使用其他应用程序来显示图像,则可以使用SITK_SHOW_COMMAND环境变量。

更多的文档关于doxygen的显示功能: https://itk.org/SimpleITKDoxygen100/html/namespaceitk_1_1simple.html#ac8416e6e7f02dedfe8373b83dbea411d

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