如何绘制R中的二元变量集群？

Question

嗨！

我是在R中使用kmeans和聚类的新手。我一直在试图弄清楚如何以一种漂亮和可代表的方式可视化群集。

我附上了一张数据表的样子。有更多的列变量，但这个样本应该做的。这些数据最初来自调查，答案记录为0和1，然后相应地使用kmeans进行聚类。

我会很感激任何意见或帮助如何绘制此。

Answer 1

我认为这样做最简单的方法是通过某种类型的协调，然后绘图与文字标签表明该集群中的数据点在协调。

我会使用数据举一个例子包括在素食节目。我不会在协调之前包括标准化数据等步骤，或者说明应该使用什么协调方法。这将取决于数据的类型。

library(vegan) 
data(varespec) 
ord=metaMDS(varespec,k=3,engine="monoMDS") #create ordination 
km=kmeans(varespec,3) #kmeans clustering with 3 groups 
fig=ordiplot(ord) 
ordiplot(fig,type="n") #plot ordination 
text(fig,"sites",km$cluster,cex=0.8) #add cluster membership as text 

这将会给你一些基本的东西，像这样：

，但这可能不是太漂亮，但很容易解释。