以便捷的方式维护MPI版本和非MPI版本

最近，我使用MPI并行化我的仿真程序以加快速度。我采用的方式是重写一个非常耗时但易于并行化的函数。以便捷的方式维护MPI版本和非MPI版本

非MPI程序的简化模型如下，

int main(int argc, char* argv[]){ 
    // some declaration here 
    Some_OBJ.Serial_Function_1(); 
    Some_OBJ.Serial_Function_2(); 
    Some_OBJ.Serial_Function_3(); 
    return 0; 
}

虽然我的MPI版本，

#include "mpi.h" 
int main(int argc, char* argv[]){ 
    // some declaration here 
    MPI_Init(NULL, NULL); 
    Some_OBJ.Serial_Function_1(); 
    Some_OBJ.Parallel_Function_2(); // I rewrite this function to replace Some_OBJ.Serial_Function_2(); 
    Some_OBJ.Serial_Function_3(); 
    MPI_Finalize(); 
    return 0; 
}

我复制了我的非MPI代码到一个新的文件夹，像mpi_simulation ，并添加一个mpi函数，将主文件修改为。它工作，但非常不方便。如果我更新了一些函数，比如说OBJ.Serial_Function_1（），我需要谨慎地复制代码，即使我只是改变一个常量。这些版本的程序之间仍然存在一些细微的差异。我感到筋疲力尽，以保持一致。

所以我徘徊是否有办法让MPI程序依赖于非MPI版本，以便我的修订版可以方便地应用到它们两个上。

谢谢。

更新我终于采用haraldkl的建议。的方法是定义一个宏以包围使用MPI接口，这样所有的功能：

#ifdef USE_MPI 
void Some_OBJ::Parallel_Function_2(){ 
    // ... 
} 
#endif

要自动初始化MPI，我定义了一个称为MPI_plugin单：

#ifdef USE_MPI 
class MPI_plugin{ 
private: 
    static MPI_plugin auto_MPI; 
    MPI_plugin(){ 
     MPI_Init(NULL, NULL); 
    } 
public: 
    ~MPI_plugin(){ 
     MPI_Finalize(); 
    } 
}; 
MPI_plugin::MPI_plugin auto_MPI; 
#endif

包含MPI_plugin.h在编译MPI版本时，在main.cpp中可以通过在main.cpp中添加MPI_Init（）和MPI_Finalize（）来存活。最后一步是在生成文件中添加假目标“MPI”：

CPP := mpic++ 
OTHER_FLAGS := -DUSE_MPI 
.PHONY: mpi 
mpi: ${MPI_TARGET} 
...

我希望它有帮助的人谁遇到同样的问题。

来源

2012-04-29 anecdote

通常预处理是用来达到这个目的的，对你来说这不是一个可行的选择吗？ – haraldkl 2012-04-29 08:38:27

是否严格需要非平行版本的代码？将它编译或在没有MPI的机器上运行？ – suszterpatt 2012-04-29 10:43:32

是的，我在一台没有特权安装MPI并在其他集群中运行任务的计算机上开发它。 – anecdote 2012-04-30 09:34:23

解决您的问题的一种方法是安装（如果尚未安装）可用的“虚拟MPI”库之一。只要你的代码在一个MPI过程中正确运行（我相信你已经写好了它），那么当链接到一个虚拟MPI库时，它应该正确运行。如果您不熟悉虚拟MPI库，Google。

来源

2012-04-29 17:10:05

这可能有效，因为它可以在一个节点上正确运行。然而，我没有特权将MPI安装在我用来开发项目的机器上（也是服务器）。通常，我将源代码上传到群集，使用mpiC++进行修改和编译，并通过PBS提交任务。 – anecdote 2012-04-30 09:32:42

所以你问系统经理是否有虚拟MPI安装，他们说'不'？ – 2012-04-30 09:36:03

不幸的是，是的。经理说，由于他们没有集群来支持它，所以没有必要安装MPI库。我想真正的原因是他不愿意为了我的程序的兼容性而陷入困境。 – anecdote 2012-04-30 11:13:24

以便捷的方式维护MPI版本和非MPI版本

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