HeatMap和Dendogram与100s的记录

Question

我想绘制热图和100s行的树状图，但我发现情节看起来非常拥挤，并且树状图和名称重叠。

nba <- read.csv("http://datasets.flowingdata.com/ppg2008.csv", sep=",") 

dat<-rbind(nba,nba,nba) 

nba_matrix <- data.matrix(dat) 

nba_heatmap <- heatmap(nba_matrix, Rowv=NA, Colv=NA, col=cm.colors(256), 
         scale="column", margins=c(5,10)) 

有什么办法伸展情节的尺寸，使得它会更好看？

Answer 1

如果你还没有写过，你应该把它写到一个文件中。看起来heatmap显示了一个你无法控制比例的图像（它总是正方形）。所以你需要让你的帆布很大以适应你的需要！

数百行，你将需要使画布非常大，不会有文字重叠。

将其发送到PDF：

pdf("~/test.pdf", height=20, width=20) 
heatmap(nba_matrix, Rowv=NA, Colv=NA, col = cm.colors(256), 
     scale="column", margins=c(5,10)) 
dev.off() 

具有与height戏和width参数，它看起来像你想要的。另请参阅png和相关的图形驱动程序。

nb：运行dev.off()来关闭图形设备非常重要。否则文件写入不会完成，随后的图形也将被发送到文件。