修改每一行的文本文件在Python

Question

我有一个大文件，像下面的例子：

1 10161 10166 3 
1 10166 10172 2 
1 10172 10182 1 
1 10183 10192 1 
1 10193 10199 1 
1 10212 10248 1 
1 10260 10296 1 
1 11169 11205 1 
1 11336 11372 1 
2 11564 11586 2 
2 11586 11587 3 
2 11587 11600 4 
3 11600 11622 2 

我想在每行开头加上“CHR”，例如：

chr1 10161 10166 3 
chr1 10166 10172 2 
chr1 10172 10182 1 
chr1 10183 10192 1 
chr1 10193 10199 1 
chr1 10212 10248 1 
chr1 10260 10296 1 
chr1 11169 11205 1 
chr1 11336 11372 1 
chr2 11564 11586 2 
chr2 11586 11587 3 
chr2 11587 11600 4 
chr3 11600 11622 2 

我尝试在Python下面的代码：

file = open("myfile.bg", "r") 
    for line in file: 
     newline = "chr" + line 
    out = open("outfile.bg", "w") 
    for new in newline: 
     out.write("n"+new) 

但没有返回我想要的东西。你知道如何解决这个问题的代码吗？

Answer 1

的问题是你迭代的输入和再设定相同的变量（newline）为每一行，然后打开文件的输出值并迭代newline它是一个字符串，所以new将在该字符串中的每个字符。

我觉得这样的事情应该是你在找什么：

with open('myfile.bg','rb') as file: 
    with open('outfile.bg','wb') as out: 
    for line in file: 
     out.write('chr' + line) 

当遍历文件，line应该已经包含了结尾的新行。

with语句将在块结束时自动清理文件句柄。

Answer 2

与您的代码的问题是，你遍历输入文件，而不与数据做任何你读到：

file = open("myfile.bg", "r") 
for line in file: 
    newline = "chr" + line 

最后一行分配在myfile.bg到newline变量（一个字符串的每一行，用'chr'前置），每行覆盖前一个结果。

然后你遍历字符串中newline（这将是在输入文件的最后一行，与'chr'预谋）：

out = open("outfile.bg", "w") 
for new in newline:  # <== this iterates over a string, so `new` will be individual characters 
    out.write("n"+new) # this only writes 'n' before each character in newline 

如果你只是在做这一次，例如在外壳，你可以使用一个班轮：

open('outfile.bg', 'w').writelines(['chr' + line for line in open('myfile.bg').readlines()]) 

更正确的（尤其是在一个程序中，在那里你会在乎打开的文件句柄等）将是：

with open('myfile.bg') as infp: 
    lines = infp.readlines() 
with open('outfile.bg', 'w') as outfp: 
    outfp.writelines(['chr' + line for line in lines]) 

如果文件是真的大（接近可用内存的大小），你需要逐步处理它：

with open('myfile.bg') as infp: 
    with open('outfile.bg', 'w') as outfp: 
     for line in infp: 
      outfp.write('chr' + line) 

（这比第t慢得多窝版本虽然..）

Answer 3

完全符合@rychaza同意，这是一个使用你的代码

file = open("myfile.bg", "r") 
out = open("outfile.bg", "w") 
for line in file: 
    out.write("chr" + line) 
out.close() 
file.close()