非常大的二进制数据的数据结构

Question

我正在构建一个遗传算法，我想知道什么是用于编码染色体（基本上是0和1的长序列）的好数据结构。

我的目标是在染色体内随机改变位并在染色体之间进行交换的效率。本质上是复制和更改位或位的子序列。

到目前为止，我只是坚持一个普通的布尔数组，但我觉得应该有一个更好的数据结构来处理大量的二进制数据。

有什么建议吗？

Answer 1

切换到使用int原语来表示组的二进制值，并使用按位操作和掩码来更改二进制值组可能会使您获得大幅度的速度增加，具体取决于您如何操作数据。您可以使用随机生成的蒙版一次随机突变基因块。

如果您正在扫描整个事物或提前知道索引，则阵列很难击败。但是，将数组的部分复制到其他部分可能具有挑战性，但其效率仍然相当高。

如果你更关心交换固定大小的基因组，建立一个具有n个分支的2级树，每个叶子上的基因组可以让你快速交换基因组。这些组可能不需要是相同的大小。如果你需要将基因进一步分解为染色体，你可以在树上添加一个中间级别。