python循环字典值引用更新所有值

Question

我在更新python字典中的值时遇到问题。我试图更新一个嵌套的值（无论是作为一个int或列表）为一个拳头级别的关键，而是我更新的值，所有第一级别的关键。

我开始通过创建字典：从列表

kmerdict = {} 
innerdict = {'endcover':0, 'coverdict':{}, 'coverholder':[], 'uncovered':0, 'lowstart':0,'totaluncover':0, 'totalbases':0} 
for kmer in kmerlist: # build kmerdict 
    kmerdict [kmer] = {} 
    for chrom in fas: #open file and read line 
     chromnum = chrom[3:-3] 
     kmerdict [kmer][chromnum] = innerdict 

那么我走通过染色体（为纯文本文件）（FAS，未示出），并采取7聚体字符串（K = 7），为钥匙。如果该键是键我期待的（kmerlist），并试图用它来引用嵌套在字典中的单个值的列表：

for chrom in fas: #open file and read line 
    chromnum = chrom[3:-3] 
    p = 0 #chromosome position counter 
    thisfile = "/var/store/fa/" + chrom 
    thischrom = open(thisfile) 
    thischrom.readline() 
    thisline = thischrom.readline() 
    thisline = string.strip(thisline.lower()) 
    l=0 #line counter 
    workline = thisline 
    while(thisline): 
     if len(workline) > k-1: 
      thiskmer = '' 
      thiskmer = workline[0:k] #read five bases 
      if thiskmer in kmerlist: 
       thisuncovered = kmerdict[thiskmer][chromnum]['uncovered'] 
       thisendcover = kmerdict[thiskmer][chromnum]['endcover'] 
       thiscoverholder = kmerdict[thiskmer][chromnum]['coverholder'] 
       if p >= thisendcover: 
        thisuncovered += (p - thisendcover) 
        thisendcover = ((p+k) + ext) 
        thiscoverholder.append(p) 
       elif p < thisendcover: 
        thisendcover = ((p+k) + ext) 
        thiscoverholder.append(p) 
      print kmerdict[thiskmer] 
      p += 1 
      workline = workline[1:] 
     else: 
      thisline = thischrom.readline() 
      thisline = string.strip(thisline.lower()) 
      workline = workline+thisline 
      l+=1 
print kmerdict 

但是当我打印的字典，所有的“thiskmer”水平正在更新相同的值。我对字典不太擅长，我也看不到我的方式错误，但他们是深刻的！任何人都可以启发我吗？

希望我已经清楚了。我一直在修改这段代码太久了:(

Answer 1

忏悔 - 我没有花时间弄清楚你的所有代码 - 只有第一部分。你遇到的第一个问题是在设置：

kmerdict = {} 
innerdict = {'endcover':0, 'coverdict':{}, 'coverholder':[], 'uncovered':0, 
      'lowstart':0,'totaluncover':0, 'totalbases':0} 
for kmer in kmerlist: # build kmerdict 
    kmerdict [kmer] = {} 
    for chrom in fas: #open file and read line 
     chromnum = chrom[3:-3] 
     kmerdict [kmer][chromnum] = innerdict 

创建innerdict一次，然后继续反复使用相同的字典过的。换句话说，每个kmerdict[kmer][chromnum]指的是相同的对象也许改变最后一行：。

kmerdict [kmer][chromnum] = copy.deepcopy(innerdict) 

会有帮助（在文件顶部有一个适当的copy导入）？另外，您也可以只移动的innerdict创建到内环在评论中指出：

def get_inner_dict(): 
    return {'endcover':0, 'coverdict':{}, 'coverholder':[], 'uncovered':0, 
      'lowstart':0,'totaluncover':0, 'totalbases':0} 

kmerdict = {} 
for kmer in kmerlist: # build kmerdict 
    kmerdict [kmer] = {} 
    for chrom in fas: #open file and read line 
     chromnum = chrom[3:-3] 
     kmerdict [kmer][chromnum] = get_inner_dict() 

- 我决定使用的功能，使其更容易阅读:)。