使用read.table读取CSV文件会给出带引号的表格

我正尝试使用read.table命令读取R中的csv文件，并且我在R中得到的表格每个条目都有双引号。问题是我不能用引号将这些条目用于数学运算。使用read.table读取CSV文件会给出带引号的表格

这是我读命令：

exprs_data <- as.matrix(read.table("Test1.csv", 
    sep= ",",header=TRUE,row.names=1,as.is=TRUE))##

这里是R中导入的表：

ABC DEF XYZ 
m0122 " 854" "1487" "1855" 
m0152 " 97" " 159" " 468" 
m0257 " 157" " 733" " 6"

为什么有数字加引号？我之前从来没有遇到过这个问题。任何人都可以帮我在R中导入这个csv文件吗？

来源

2014-06-21 Bade

你能显示'str（exprs_data）'的结果吗？ –

嗨，本，这是原始文件str（exprs_data）的结果：chr [1：4,1：22]“NEW”“NEW”“NEW”“NEW”“NEW”“NEW”“NEW”“NEW “”m0122“”m0152“”m0257“”m0427“... - attr（*，”dimnames“）=列表2 .. $：chr [1：4]”m0122“”m0152“”m0257“ “m0427” .. $：chr [1:22]“annotation”“Annotation2”“Generic_name”“Name”... – Bade

如果省略'as.matrix（）'，该怎么办？用任何非数字列强制数据框会给你一个字符矩阵（如你所知）。 –

引号表示矩阵中的值是字符串而不是数字。不知道你的csv文件是什么样子的，我怀疑文件中的某些值不是有效的数字，并且在转换为矩阵（你的as.matrix）语句时，一切都转换为字符串以符合矩阵的所需结构（需要是全部相同的数据类型）。我不完全确定为什么要进行矩阵转换，但是您可以通过使用colClasses参数明确指定read.table数据的类型。试试这个（假设所有列都被视为数字，否则colClasses使用不同值的向量为每列）：

exprs_data <- read.table("Test1.csv", sep= ",", header=TRUE, 
         row.names=1, colClasses = "numeric")

你可以将其转换为一个矩阵，如果你想，但你也可以直接上班与read.table返回的数据帧。如注释中所述，您可以通过运行str(exprs_data)来获取有关变量的结构（包括列数据类型）的详细信息。

来源

2014-06-21 22:11:03 sebkopf

感谢您的提示。删除'as.matrix'可以解决问题。由于'heatmap2'软件包需要一个数字矩阵，所以默认是在mt read命令中。现在我读取文件，提取数字列并转换为矩阵。 – Bade

使用read.table读取CSV文件会给出带引号的表格

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