R：as.numeric数据框混乱值的顺序

Question

我在下面粘贴了我的代码的重要部分。基本上我创建了一个data.frame，其中两列包含数值，一列包含因子。

我试图将“位置”列转换为数值，但是一旦我这样做，位置值出于某种原因切换。

f <- fread("ABC.txt",header=F,skip=1)$V1 
f <- paste(f, collapse = "") 

vector <- 1:stri_length(f) 

fillmatrix <- c(rbind(strsplit(f, "")[[1]], vector)) 
A <- data.frame(1,matrix(fillmatrix, ncol=2, byrow = TRUE)) 
A <- A[c(1,3,2)] 
colnames(A)=c("Track","Location","Base") 

class(A$Track) 
# [1] "factor" 

A[1:15,] # Before as.numeric 
    Track Location Base 
# 1  1  1 A 
# 2  1  2 C 
# 3  1  3 G 
# 4  1  4 G 
# 5  1  5 A 
# 6  1  6 A 
# 7  1  7 T 
# 8  1  8 A 
# 9  1  9 A 
# 10 1  10 A 
# 11 1  11 A 
# 12 1  12 T 
# 13 1  13 T 
# 14 1  14 C 
# 15 1  15 C 

a <- transform(A, Location = as.numeric(Location), Track = as.numeric(Track)) 

a[1:15,]  # After as.numeric 
# Track Location Base 
# 1  1  1 A 
# 2  1  112 C 
# 3  1  223 G 
# 4  1  334 G 
# 5  1  445 A 
# 6  1  556 A 
# 7  1  667 T 
# 8  1  679 A 
# 9  1  690 A 
# 10 1  2 A 
# 11 1  13 A 
# 12 1  24 T 
# 13 1  35 T 
# 14 1  46 C 
# 15 1  57 C 

A数据帧相当长〜700行长。我创建数据的方式是这个问题吗？或者我忽略了一个小错误？

感谢您的帮助

Answer 1

一个可重复的例子会很好。

我怀疑这是因为class(A$Location)是一个因素，而不是一个字符。 在这种情况下，您需要as.numeric(as.character(Location))才能根据需要获取数字。这是因为R在做一个（字符串，不是数字 - 因此10在2之前）排序之后编码因子就像整数1:nlevels(your.factor)。

你可以在你data.frame呼叫建立stringsAsFactors=F - 在你的fillmatrix <- ...行你似乎通过“做strsplit转产一切字符”（？为什么你粘贴f在一起只是为了回来了再拆呢）