2017-07-03 106 views
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我想使用imshow绘制二维数组,但是出现内存错误。我试图通过在可能的情况下将浮点数更改为整数来提高内存效率,但我仍然遇到错误。Imshow二维数组内存错误

源文件是一个包含3列的文件:x,y和z(无标题,空格分隔)。由于X和Y在5x5网格上,我除以5)。二维数组的形状(下面例子中的“arr”)是(7422,9637),这很大,但我并没有预料它太大。仅绘制[:4000,:4000]已经太多了。

的代码我使用:

fn = 'xyzData.pts' 
data = pd.read_csv(fn, delim_whitespace=True, decimal='.', header=None, 
names=['x', 'y', 'z'], dtype={'x': np.int32, 'y': np.int32, 'z': np.float32}) 

minX = data.x.min() 
maxX = data.x.max() 
minY = data.y.min() 
maxY = data.y.max() 

stepSize = 5 

arr = np.zeros(((int(maxY-minY)/stepSize)+1, (int(maxX-minX)/stepSize)+1)) 
arr[:,:] = np.nan 
arr[((data.y-minY)/stepSize).astype(int), ((data.x-minX)/stepSize).astype(int)] = data.z 

plt.imshow(arr, extent=(minX, maxX, maxY, minY), cmap=cm.gist_rainbow) 
plt.colorbar() 
plt.show() 

是否有任何地方我需要改善我的代码或imshow只是有缺陷?在这种情况下,我需要找到替代方案(任何想法?)。

帮助非常感谢,谢谢。

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'imshow'可以处理'nan'值吗?这个代码是否可以用一个非常小的矩阵工作,比如10x10? –

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是的,它可以和nan值一起工作。 Nan值表示为无色像素。 – Yorian

回答

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使用64位python修复它。