Python网络x：边缘收缩

Question

我有一个NetworkX图。我想知道如何在多个节点之间做edge contraction。

例如，如果我想承揽X，Y和Z：

  _ node A _ 
     _/ |  \_ 
node X --- node Y --- node Z 

将成为

  node A 
      |  
      node XYZ (or whatever X/Y/Z) 

图形创作是没有问题的。有用。我想通过合并具有相同“含义”的节点来缩小图形：我称之为“end lvl”（节点名称长度等于7）并链接在一起的节点。

我发现在NetworkX凝聚作用，所以我尝试使用它：

# edge contraction for same nodes 
# for each node, get the links to other nodes "end lvl" 
# if there is such a link, it means that these node are 
# the sames 
# 
# copy graph 
I = G 
for n,d in G.nodes(data=True): 
    if n in I.nodes(): 
     if len(n) == 7: 
      # list of nodes adjacent to n : filter only "end lvl" nodes 
      neighbors = [ node for node in I.neighbors(n) if len(node) == 7 ] 
      nodes_to_merges = neighbors.append(n) 
      I = nx.condensation(I,scc=nodes_to_merges) 

当我转换成JSON我得到的东西是：

{"directed": true, "graph": [], "nodes": [{"id": 0}], "links": [], "multigraph": false} 

有一个问题，因为你可以看到...

对函数的引用是here。

Answer 1

如何：

add_node(XYZ) 
add_edge(XYZ, A) 
for edge incident on (X, Y, Z): 
    v = nodes in edge not in (X, Y, Z, A) 
    if v: 
     remove_edge(edge) 
     add_edge(v, XYZ) 
for node in (X, Y, Z): 
    remove_node(node) 

Answer 2

，而不是试图用nx.condensation（这是指承包强连通分量，而不是组一般节点）使用这些功能：

http://networkx.readthedocs.io/en/stable/reference/classes.graph.html#adding-and-removing-nodes-and-edges

删除除了一个折叠节点之外的所有节点并重新连接它们的节点。