bash命令不会在Python

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正常运行

Co-sqp-C70.pdos_atm*5*C*_wfc*2*p* 
Copilot

使用ls Co-sqp*过滤器下面的文件，以便输出

Co-sqp-C70.pdos_atm*5*C*_wfc*2*p*

然而，在Python脚本，我使用

cmd = ["ls", self.prefix+".pdos_atm*wfc*"] 
output = subprocess.Popen(cmd,stdout=subprocess.PIPE,shell=True).communicate()[0] 
print(output) 
return output.splitlines()

和输出包含两个文件

Co-sqp-C70.pdos_atm*5*C*_wfc*2*p* 
Copilot

我在做错了python代码导致脚本不能正确过滤ls输出？

来源

2016-11-25 noobProgrammer

你有一个文件名与嵌入星号？ – cdarke

不要在Python中使用bash（除非你绝对需要）使用Python。查看'os'和'glob'库 – IanAuld

@cdarke它是运行计算的程序的输出文件。我没有办法编辑输出文件名格式，所以脚本的目的是整理文件名 – noobProgrammer

要扩展IanAuld的评论，我想为您提供两种解决方案，可以在不依赖调用子流程的情况下解决您的问题。使用子进程有点笨重，为了查找文件，python提供了几个强大的pythonic选项。

我创建了一个包含两个文件与你所描述的名字和父文件夹中的python脚本的文件夹命名的文件：

find_files.py 
files/ 
    Co-sqp-C70.pdos_atm*5*C*_wfc*2*p* 
    Copilot

现在有几个选项来做到这一点：

import glob 
import os 

# a glob solution 
# you can use wildcards etc like in the command line 
print(glob.glob("files/Co-sq*")) 

# an os solution 
# you can walk through all files and only print/ keep those that start with your desired string 
for root, dirs, files in os.walk("files/"): 
    for file in files: 
     if file.startswith("Co-sq"): 
      print(file)

我更喜欢glob解决方案来查找文件，因为它非常灵活且易于使用。顾名思义，glob允许您在命令行中使用glob patterns。

来源

2016-11-25 09:46:16 m00am

您的命令不是bash它是ls。有没有参与，扩大你的文件名模式self.prefix+".pdos_atm*wfc*"外壳，让ls获取作为文字的说法，因为如果你想进入（中壳）

ls 'Co-sqp-C70.pdos_atm*wfc*'

您至少有下列选项：

调用一个壳以扩大图案：

cmd = [ "sh", "-c", "ls " + self.prefix + ".pdos_atm*wfc*"]

等价：

cmd = "ls " + self.prefix + ".pdos_atm*wfc*"

如果self.prefix不能保证是shell-clean，这是有风险的。

展开水珠，并将结果传递给ls：
```
import glob 
cmd = ["ls"] + glob.glob(self.prefix+".pdos_atm*wfc*") 
```
你还在使用ls，这是不打算给解析的输出。除了简单地将输出传递给用户（例如在日志文件中）之外，不要做任何事情。
展开水珠，并处理在Python结果：
```
import glob 
for file in glob.glob(self.prefix+".pdos_atm*wfc*"): 
    some_function(file) 
```
如果您要检查以任何方式文件条目你应该这样做。

来源

2016-11-25 10:17:14

bash命令不会在Python

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