roxygen2

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    我正在做我的第一个包rlandscape,使用Roxygen2并试图遵循普通的Roxygen小插曲,因为Roxygen2没有。 与the vignette(第3页)一样,我创建了一个名为rlandscape-package.R的文件,其中只包含文档包。在晕影,他们说 每个Roxygen描述块必须跟随的声明,即使 头材料描述了一种文件或包代替特定 功能。对于这种情况,roxygen()作为NOOP(

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    我收到了一个我无法理解的错误roxygenize()。我有一个我通过roxygen生成.Rd文件的杂项功能包。 错误是Error: titlerequires a value,这表明没有@title标记。但kmmisc-package.R文件中有一个@title标记,所以我不确定问题是什么。 kmmisc-package.R包含: ##' Miscellaneous Functions ##'

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    我试图使用roxygen2记录R程序包中的一些数据集。这些考虑只有一个: 我mypkg/data/CpG.human.GRCh37.RDa ,内含CpG.human.GRCh37 的对象,一个名为:mypkg/R/cpg-data.R,其中包含: #' @name CpG.human.GRCh37 #' @title CpG islands - human - genome build: GRC

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    我有一个功能,除了为任何R对象广告一个唯一的attr外,基本演示: #' Setter function #' @param x an R object #' @param value a character value to set #' @export `foo<-` <- function(x, value){ attr(x, 'foo') <- value re

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    假设我正在编写一个小R包,其中包含两个函数,其中除了一个外,其余参数都是相同的。这里有一个例子: fct1 <- function(r, K){...} fct2 <- function(r, p, K){...} 在我使用下面的标签的第一个函数的我roxygen2文档: #' @param r description of argument r #' @param K descripti

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    我正在开发一个R包,使用devtools,testthat和roxygen2。我在数据文件夹中有几个数据集(foo.txt和bar.csv)。 我的文件结构如下: / mypackage /data * foo.txt, bar.csv /inst /tests * run-all.R, test_1.R /man /R

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    一个简单的例子是我创建了一个扩展到show,这是一个S4基本方法。我不想通过重新记录show在我的包引起歧义叉,我也希望我的分机的文档巩固show文档中新类,myPkgSpClass,通过添加一个别名show,myPkgSpClass-method。 #' @export #' @aliases show,myPkgSpClass-method #' @rdname myPkgSpClass-

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    我正在开发一个提供名为“Foo”的S3类的包。它还提供了一个“as”方法将它强制转移到名为“Bar”的(别人的)S4类。我的代码如下所示: #' ... setOldClass("Foo") #' ... setAs("Foo", "SpatialPointsDataFrame", function(from) { # do stuff and return a SpatialP

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    当我运行以下命令: library(devtools) install_github('roxygen2') 我得到以下错误: 与devtools 0.51: Installing roxygen2 from hadley Error in unzip(src, list = TRUE) : zip file '/tmp/Rtmp2b44Ug/hadley-roxygen2.zi

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    roxygen文档中逃脱的报价我有我的文档中的R功能的例子,需要逃跑报价: #' @examples msearch("published_in:\"Journal of Ecology\"") (至少我没有足够的智慧避免逃避报价)。虽然此命令在R中正确工作,但roxygenize/document函数将其转换为.Rd文件中的双重转义 msearch("published_in:\\"Jour