mothur

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R包重塑函数融化错误：在处理很多因素时数据中找不到id变量

我正在使用mothur的稀疏输出，它基本上给了我一个数据集，其中包含采样序列数和独特数序列在几个样本中。我想用ggplot2来显示这些数据，因此需要使用melt从wide转换为long格式。 问题是我找不到这个工作的原因，因为melt的错误。这基本上指出 Error: id variables not found in data: 1,3,6, (... and so on) 由于原始数据集的大小

r reshape melt mothur 2012-09-07

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从文件中输出选定的行作为第一列，文件名称作为第二个coulmn

我刚刚开始在win7中使用powershell，以便为程序mothur生成管道式脚本。之前我在ubuntu中使用bash脚本来做到这一点。我很高兴现在一切都运作良好，除了一个任务： 我想喜欢格式化FASTA文件的格式为： filename.fasta: >HXXC990 AGTTCAAGGTCTCT >HXXC991 GGGTTTCAAATCTC >HXXC992 GGGTCTCTC

powershell text-files data-conversion mothur 2013-04-06

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如何生成从距离矩阵中的R的排序图

这里我有另一个“的图形”的问题： 我从MOTHUR获得以下距离矩阵（从加权unifrac分析未来）： 20 F3D0 F3D1 0.222664 F3D141 0.157368 0.293308 F3D142 0.180278 0.319198 0.0944511 F3D143 0.157659 0.290975 0.0545202 0.0761392 F3D144 0.1

r matrix distance mothur 2017-07-06

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