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我使用以下shell脚本在集群上运行模拟。变量未在shell脚本中识别
#PBS -N 0.05_0.05_m_1_200k
#PBS -l nodes=1:ppn=1,pmem=1000mb
#PBS -S /bin/bash
#$ -m n
#$ -j oe
FOLDER= 0.57
WDIR=/home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER
cd /home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER
LAMBDA= 0.05
/home/durba/gmx455/bin/mdrun -np 1 -deffnm md0.05 -v
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现在我的问题是,我的脚本不能识别变量文件夹,并抛出一个错误
couldn't find md0.05.tpr
其存在的文件夹中。如果我在$文件夹的位置写入0.57,它工作正常,这让我觉得它不能识别变量FOLDER。 LAMBDA在这两种情况下都是完美的认可。如果有人能帮助我,我会很感激。
它的工作表示感谢。 –