numpy condition loop np.其中

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我试图将样本列与两个参考列D和R进行比较。如果样本匹配D或R，则用D或R替换该数据;除非./。在样本列中，我希望呼叫是NR。我已经添加了LogicCALL列在我的实际数据的数据帧到demonstrate--这些电话将取代（1,0，./。）numpy condition loop np.其中

ReferenceD ReferenceR sample LogicCALL 
0   1   0  1   D 
1   1   1 ./.  NC 
2   1   0  0   R 
Index(['ReferenceD', 'ReferenceR', 'sample', 'LogicCALL'], dtype='object')

为了这一点，我有以下构建循环; Alt是样本列表。该循环适用于调用D和R而不是NC，而脚本返回“R”。

for sample in Alt: 
     gtdata[(sample)] = np.where((gtdata[(sample)] == gtdata['ReferenceD']) & (gtdata[sample] != gtdata['ReferenceR']), "D", 
           np.where((gtdata[(sample)] == "D") & (gtdata[(sample)] is not ('\./.')), "D", 
              np.where((gtdata[(sample)] == "D") & (gtdata[(sample)].str.contains('\./.')), "NC", 
                "R")))

来源

2017-03-08 lager

我没有看到一个循环。我看到嵌套或顺序的'where'。很难说哪个。我不得不将它复制到一个编辑器并将其分解成可读的部分。 – hpaulj

这不是一个功能性的语法，但最可读的方式做这将是程序上使assignemnts：

df.loc[df['ReferenceD'].astype(str) == df['sample'], 'LogicCALL'] = 'D' 
df.loc[df['ReferenceR'].astype(str) == df['sample'], 'LogicCALL'] = 'R' 
df.loc[df['sample'] == './.',      'LogicCALL'] = 'NR'

来源

2017-03-08 22:41:08 maxymoo

numpy condition loop np.其中

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